Поиск информации в Интернете и электронной базе данных

Размещено на http://www.allbest.ru/

Тема: «Второй и третий этапы ДМ. Поиск информации в Интернете и электронной базе данных. Система библиографического поиска медицинской информации - Medline. Анализ статей и их критическая оценка»

Информационные системы

БД -- один из основных компонентов современных информационных систем. Информационная система -- взаимосвязанная совокупность средств, методов и персонала, используемых для хранения, обработки и выдачи информации.

Цель любой информационной системы -- обработка информации конкретной предметной области. Пример -- системы поддержки клинических решений. Обычно они представляют БД, которые объединяют электронные истории болезни со специальными инструментами, такими как автоматические напоминания или калькуляторы дозировки ЛС, предназначенные для использования клиницистами в процессе принятия решений. В основу систем поддержки должны быть положены научно обоснованные руководства по клинической практике или другие достоверные данные научных исследований.

В настоящее время медицинские информационные системы -- одна из приоритетных областей разработки программных средств во всем мире и представляют трудоемкую задачу из-за целого ряда факторов:

множества факторов и сложности их взаимодействия в процессе принятия медицинских решений;

отсутствия стандартизации в терминологии, формате, шкалах измерения;

высоких требований к параметрам компьютеров по скоростям доступа, объемам памяти, обработке графики.

Базы данных. БД можно определить как организованную совокупность взаимосвязанных хранимых вместе данных, представленных на электронных носителях, предназначенных и пригодных для решения специальных задач с использованием средств вычислительной техники.

Особенности такой совокупности данных:

большие объемы информации;

максимально возможная компактность хранения данных;

возможность извлечения из БД разнообразной информации в определенной предметной области;

удобные для пользователя вид и форма извлекаемой информации;

высокая скорость доступа к данным;

надежность хранения информации и возможность предоставления санкционированного доступа к данным для отдельных пользователей;

удобство и простота конструирования пользователем запросов, форм и отчетов для выборки данных.

Создание БД, ее поддержка и обеспечение доступа пользователей к ней осуществляют с помощью специального программного инструмента -- системы управления базами данных. Система управления базами данных (СУБД) -- программное обеспечение для создания и редактирования баз данных, просмотра и поиска информации в них.

По технологии обработки и хранения данных БД делят на централизованные и распределенные.

Централизованные БД по способу доступа делят на:

БД с локальным доступом (данные и процедуры их обработки хранятся на одной машине);

БД с удаленным (сетевым) доступом. Системы управления базами данных с удаленным доступом могут быть построены с использованием архитектур файл-сервер и клиент-сервер.

Архитектура файл-сервер

Принцип организации: одна машина выделена в качестве центральной (сервер файлов), на ней хранится централизованная БД. Остальные машины сети выполняют функции рабочих станций. Файлы БД в соответствии с пользовательскими запросами рабочих станций передаются на эти станции и там обрабатываются. Производительность такой системы падает, если требуется интенсивный одновременный доступ к одним и тем же данным. В настоящее время эту архитектуру считают устаревшей.

Архитектура клиент-сервер

Принцип организации: центральная машина (сервер БД) хранит централизованную БД и процедуры обработки. Клиент посылает запрос, он обрабатывается сервером, и данные, полученные по запросу, передаются клиенту.

Распределенная БД состоит из нескольких частей, хранимых на различных компьютерах вычислительной сети. Этот способ обработки подразумевает наличие нескольких серверов (обслуживающих компьютеров), на которых может храниться пересекающаяся или даже дублирующая информация. Для работы с такой БД используют систему управления распределенными БД.

По используемой модели БД разделяют на иерархические, сетевые реляционные, объектно-ориентированные и гибридные.

Иерархическая модель БД состоит из объектов с указателями от родительских объектов к потомкам, соединяя вместе связанную информацию.

К основным понятиям сетевой модели БД относят: уровень, элемент (узел) и связь. Узел -- совокупность атрибутов данных, описывающих некоторый объект. В сетевой структуре каждый элемент бывает связан с любым другим элементом. Сетевые БД подобны иерархическим, за исключением того, что в них имеются указатели в обоих направлениях, которые соединяют родственную информацию.

Реляционная модель (англ. relation -- отношение) БД ориентирована на организацию данных в виде двумерных таблиц. Для этих моделей характерна простота структуры данных, удобное для пользователя табличное представление. В реляционных БД используют язык Structured Query Language -- язык структурированных запросов -- универсальный язык, применяемый для создания, модификации и управления данными.

В объектно-ориентированных базах данные хранятся в виде объектов. С объектно-ориентированными базами данных удобно работать, применяя объектно-ориентированное программирование. Однако сегодня такие базы данных еще не достигли такой популярности, как реляционные, поскольку значительно уступают им в производительности.

Гибридные СУБД совмещают в себе возможности реляционных и объектно-ориентированных баз данных.

Сегодня БД -- мощный инструмент совершенствования процессов оказания медицинской помощи. Появление в конце XX в. медицинских БД, доступных широкому кругу пользователей, позволило проводить быстрый поиск, анализ и обобщение информации о результатах эпидемиологических и других исследований и способствовало развитию подхода к оказанию медицинской помощи, получившему название «медицина, основанная на доказательствах» (научно-обоснованная медицинская практика).

Выбор стратегии поиска информации

Часто встречающиеся типы вопросов в медицинской практике Из множества вопросов, которые могут интересовать медицинских работников можно выделить наиболее часто встречаемые типы. Это вопросы, касающиеся клинических данных, симптомов заболевания, прогноза, профилактики, этиологии и причин заболевания, вреда и риска, диагностических тестов, дифференциальной диагностики, качества жизни, терапии, экономической эффективности и др.

Для целей разработки стратегий информационного поиска можно указать 5 общих типов клинических вопросов, которые включают в себя все прочие типы.

Лечение (терапия) -- вопросы о том, какое лечение (если таковое возможно) надо назначить и какими могут быть результаты различных методов лечения. Эта группа включает также вопросы относительно профилактики, организации программ скрининга, повышения качества медицинской помощи.

Диагностика -- вопросы относительно степени надежности и клинической полезности конкретного теста, которые обычно ставят, чтобы определить, принесет ли данный тест достаточную пользу конкретному пациенту. В большинстве статей по диагностике результаты исследуемого диагностического теста сравнивают с результатами другого, стандартного теста, который рассматривают как эталонный или авторитетный («золотой стандарт»). Сюда же относят вопросы по дифференциальной диагностике.

* Прогноз -- вопросы относительно будущего состояния здоровья пациента, продолжительности и качества его жизни при выборе того или иного конкретного варианта лечения.

* Этиология/побочные эффекты -- вопросы относительно взаимосвязей между болезнью и возможными ее причинами, включая побочные эффекты, связанный с различными вариантами лечения (ЛС, терапевтическими и диагностическими вмешательствами).

* Экономическая эффективность -- вопросы относительно экономической эффективности различных лечебных, профилактических и диагностических процедур.

Использование технологии доказательной медицины предполагает поиск информации в литературе и БД. Первоочередной шаг научно обоснованной практики (доказательной медицины) -- точная формулировка «сфокусированного» вопроса.

Источники доказательной информации

Таблица 1 демонстрирует плюсы и минусы доступных источников информации.

Источник	Преимущества	Недостатки
Книги	Легкий доступ Глубина охвата Анализ Компактность Можно брать в библиотеке	Быстро устаревают Доступ к библиотекам бывает ограничен Требуется много времени для поиска и просмотра
Журналы первичной информации	Более свежая информация Легкий доступ Компактность	Не всегда содержат обзоры Дороги Доступ к библиотекам бывает ограничен Требуется много времени для поиска и просмотра Их слишком много Пристрастность публикаций
Журналы вторичной информации	Структурированные рефераты Комментарии независимых экспертов Критические оценки доказательств Методологически надежные исследования Строгие критерии отбора информации	Только рефераты Полные тексты исследований
Рефераты статей	Широкий обзор литературы В целом хорошее качество	Ограниченная глубина Часто пишут сами авторы
Библиография / списки литературы	Полезные ссылки на связанную литературу по определенной теме Выделяют статьи высокого качества	Субъективность авторского выбора Неясные критерии
Коллеги	Персональная и конкретная помощь в соответствии с вашими потребностями Помощь легко доступна	Пристрастность Приоритеты могут отличаться от ваших Недостаток времени
World Wide Web	Самые свежие данные Ценная/уникальная информация Профессиональная организация сети Полные тексты Доступ к информации со всего мира Круглосуточный доступ	Отсутствие центрального каталога -- трудно найти информацию Отсутствие цензуры и редактирования Никаких гарантий качества и достоверности Требуется подключение к Интернету и минимальные навыки в области информационных технологий
Источник	Преимущества	Недостатки
Электронная почта	Быстрая передача информации Документы можно присоединять к сообщениям Частные сообщения могут быть зашифрованы	С прикрепленными файлами бывает трудно работать Спам Угроза заражения вирусами
Списки рассылки	Связь «один со многими» Определенная тематика Можно получать только еженедельные обзоры Доступен широкий диапазон мнений Очень дешевые средства распространения Могут быть открыты или закрыты для посторонних Возможен поиск или просмотр архивов	Количество сообщений может быть разным Ошибочные сведения рассылаются всем Трудно поддерживать обсуждение
Библиографические БД	Широкий набор индексируемых журналов Регулярное обновление Экономия времени Удобство пользования Свободный текстовый поиск Развитые инструменты поиска	Отсутствие полных текстов Отражает пристрастность публикаций Не всегда доступны Иногда неудобны в использовании Трудно получать иностранные статьи
MEDLINE	Универсальность доступа Международный охват Индексация на основе предметных рубрик Поиск по типам публикаций Имеются фильтры качества	Уклон в пользу американских работ Избирательный подход к отбору журналов Плохая индексация
Кохрановская библиотека	Данные высококачественных исследований Международное сотрудничество Новейшая информация Хорошее структурирование информации Сокращает время поиска и оценки	Проблемы доступа Некоторые тематические области представлены недостаточно

С точки зрения представления и обобщения данных существуют разные виды ресурсов (как первичных, так и вторичных): журналы, книги, отчеты, руководства, БД. Информацию о клинической эффективности сейчас можно найти во множестве журналов по медицине и здравоохранению -- как национальных, так и международных.

Журналы вторичной информации

Существуют журналы, публикующие именно вторичную информацию -- обзоры и резюме доказательных данных.

АСР Journal Club

Основная цель службы American College of Physicians Journal Club состоит в том, чтобы выбирать из имеющейся биомедицинской литературы статьи с описаниями оригинальных исследований и систематические обзоры, которые необходимы для врачей, стремящихся использовать современные достижения медицины. Эти статьи обобщаются в виде рефератов и комментируются клиническими экспертами. Материалы для публикации тщательно отбирают из более чем 100 клинических журналов с использованием строгих критериев научного качества и с последующей оценкой пригодности для медицинской практики, выполняемой клиническими специалистами.

Это совместное издание British Medical Journal (BMJ) Publishing Group и American College of Physicians выходит раз в два месяца и использует менее строгие критерии отбора, чем АСР Journal Club. EBM публикует рефераты, представляющие особый интерес по терапии, хирургии, педиатрии, акушерству и гинекологии. Этот журнал имеет сильный европейский уклон. Бесплатный доступ для развивающихся стран.

Evidence-Based Mental Health

Цель издания Evidence-Based Mental Health состоит в том, чтобы информировать психиатров-клиницистов о важных и применимых в клинических условиях достижениях в области лечения (включая специфические вмешательства и системы обслуживания), диагностики, этиологии, прогнозирования и исследования результатов, улучшения качества, повышения квалификации и экономической оценки. Для этого сотрудники журнала отбирают оригинальные и обзорные статьи, результаты которых представляются наиболее точными и клинически полезными. Затем эти статьи обобщают в виде рефератов и дополняют комментариями экспертов-клиницистов. Бесплатный доступ для развивающихся стран.

Evidence-Based Nursing

Ежеквартальный журнал, выпускаемый Королевским колледжем медсестринского дела и BMJ Publishing. Чтобы помочь медсестрам, он находит и оценивает высококачественные и клинически важные исследования, публикуя сжатые информативные критические резюме таких статей с комментариями практикующих медсестер, способных определить место нового исследования в рамках данной области медицины. Бесплатный доступ для развивающихся стран.

Международный журнал медицинской практики (на русском языке) Журнал публикует структурированные рефераты ключевых, важных для практикующих врачей клинических и эпидемиологических исследований с комментариями, клинические рекомендации, статьи по методологии проведения клинических и аналитических исследований, биомедицинской статистике. На сайте представлены полные тексты всех статей. Издание возобновлено.

BMJ Updates

Этот бесплатный сервис -- совместный проект BMJ Publishing Group и Университета МакМастер (Канада). Есть возможность подписаться на рассылку (по электронной почте) информации о новых лучших доказательных публикациях по интересующей клинической специальности. Служба также включает доступ к БД резюме таких статей с 2002 года.

Базы данных первичной информации

MEDLINE

БД Национальной медицинской библиотеки США, содержащая библиографические описания статей и их рефераты (70% статей имеют рефераты). В настоящее время БД охватывает почти 4500 журналов, издаваемых в США и более чем в 70 других странах. MEDLINE включает описания 12 млн. статей, опубликованных с 1966 года по настоящее время. Новые записи добавляются еженедельно, 400 000 записей в год. Для каждой записи в MEDLINE задаются медицинские предметные рубрики (MeSH Terms) и типы публикаций (Publication Types) из словаря, контролируемого Национальной медицинской библиотекой США. Библиографические описания и рефераты MEDLINE образуют основу и доступны в составе БД Национальной медицинской библиотеки США PubMed, в которой можно проводить поиск через Интернет. MEDLINE содержит более 13 миллионов записей. Хотя сама БД не включает полных текстов статей, но их можно найти по ссылке на другом сайте (где они представлены бесплатно или платно). EMBASE

База содержит информацию по биомедицине и фармацевтике, включая биологические науки, биохимию, клиническую медицину, судебную медицину, педиатрию, фармацию, фармакологию и лекарственную терапию, фармакоэкономику, психиатрию, здравоохранение, биомедицинскую инженерию и инструментарий, окружающую среду. Источники EMBASE -- более чем 3800 журналов из 70 стран, монографии, труды конференций, диссертации и отчеты. Поиск можно проводить по библиографической информации, индексируемым терминам, рефератам, названиям химических веществ, торговым названиям ЛС, названиям фирм-производителей Л С, торговым названиям медицинских устройств, именам их производителей, молекулярным последовательностям

Базы данных вторичной информации

Кохрановская библиотека -- The Cochrane Library

Библиотека содержит четыре БД:

БД систематических обзоров;

базу рефератов эффективности лечебных вмешательств;

регистр контролируемых КИ;

базу работ по методологии обзоров.

Кохрановская библиотека доступна в сети Интернет, либо ее можно купить на CD. Опубликованные статьи вводят в Кохрановские БД участники Кохрановского сотрудничества. Каждый участник проводит вручную поиск определенного клинического журнала вплоть до его первого номера. Используя строгие методологические критерии, эти люди классифицируют каждую статью в соответствии с видом публикации (РКИ, другое контролируемое КИ, эпидемиологический обзор и т.д.) и готовят структурированные рефераты. Количественные данные в обзорах представлены в стандартном графическом виде для того, чтобы врач мог быстро и объективно их оценить.

Clinical Evidence

Доказательная медицина. Бесплатный доступ для стран с развивающейся экономикой

Этот ресурс имеет ряд особенностей.

Его содержание формируется исходя из вопросов, а не из наличия доказательных исследований. Здесь выявляют важные клинические вопросы, а уже затем ищут и обобщают лучшие из имеющихся доказательных данных для ответа на них.

Постоянно обновляется (полный литературный поиск по каждой теме проводят каждые восемь месяцев).

Clinical Evidence специально не дает рекомендаций, а предоставляет материал для разработки клинических рекомендаций локального применения, для клиницистов и пациентов, стремящихся составить собственное представление об оптимальном курсе лечения. В настоящее время этот ресурс публикуется на русском языке -- http://www. mediasphera. ru/ clinicalevidence/.

Up To Date

UpToDate -- клинический информационный ресурс, который разработан сообществом из Зтыс. опытных клиницистов и предназначен для того, чтобы врачи могли прямо на рабочем месте получать краткие и конкретные ответы на клинические вопросы. Тематические разделы UpToDate обобщают опубликованные доказательства (включая Кохрановские обзоры) и предлагают практические рекомендации по лечению пациентов, что позволяет врачам:

получать самую современную информацию по своей специальности;

распознавать клинические признаки множества заболеваний и определять реальные возможности диагностики и лечения, в том числе эффективность, дозировки и сочетаемость медикаментов;

вырабатывать оптимальные стратегии скрининга и профилактики. UpToDate -- официальная образовательная программа, которую рекомендуют или готовят в сотрудничестве с восьмью ведущими профессиональными медицинскими ассоциациями США.

Международные сотрудничества

BEME Collaboration -- Best Evidence Medical Education

Сотрудничество в области развития доказательных подходов в медицинском образовании BEME Collaboration представляет собой объединение лиц и учреждений, которые ставят своей задачей развитие доказательных подходов в медицинском образовании. Способы решения этой задачи: распространение информации, позволяющей преподавателям, учреждениям и всем, кто причастен к медицинскому образованию, принимать решения, опираясь на самые достоверные научные данные; подготовка систематических обзоров медицинского образования, отражающих наиболее достоверные имеющиеся данные и отвечающих потребностям пользователя; культивирование доказательных подходов в медицинском образовании среди преподавателей, учреждений и ведомств. Ряд тематических групп ВЕМЕ находятся на заключительном этапе подготовки своих докладов.

Evidence for Policy and Practice Information and Coordinating Centre - EPPI-Centre

Информационно-координационный центр доказательных данных в области политики и практики -- EPPI-Центр. EPPl-Центр входит в состав Отделения социологических исследований Института образования Лондонского университета. EPPI-Центр был учрежден 1993 г. для реализации систематического подхода к организации и анализу социальных вмешательств на основе доказательных данных. Деятельность и публикации Центра направлены на привлечение ответственных руководителей, практических работников и потребителей услуг здравоохранения и образования к обсуждению путей повышения актуальности проводимых исследований и способов применения их результатов. EPPI-Центр -- официальный партнер организации Campbell Collaboration (Кэмпбелловское сотрудничество), ас 1996 г. участвует в совместном руководстве Кохра-новской группой по пропаганде здорового образа жизни и охране здоровья населения (Cochrane Health Promotion & Public Health Field).

Campbell Collaboration (C2)

Кэмпбелловское сотрудничество -- международная некоммерческая организация, которая ставит перед собой цель помочь людям в принятии компетентных решений, касающихся вмешательств в социальной, поведенческой и образовательной сферах. Задачи С2 -- подготовка, сопровождение и распространение систематических обзоров исследований, посвященных различным вмешательствам. На основе результатов исследований С2 подготавливает резюме и выпускает электронные брошюры с обзорами и отчетами, предназначенные для ответственных руководителей, практических работников, исследователей и населения. Сайт организации открывает доступ к двум бесплатным БД: С2 SPECTR (Регистр социальных, психологических, педагогических и криминологических исследований) и С2 RIPE (Регистр оценки вмешательств и политики). БД C2-RIPE содержит обзоры и связанные с ними документы, представляющие интерес для исследователей, ответственных руководителей, практических работников и населения.

Для поиска информации по доказательной медицине существуют специальные инструменты поиска:

SUMSearch

«Метапоисковая служба», которая ведет поиск в следующих ресурсах:

учебники и руководства; по умолчанию используется руководство Merck Manual;

МEDLINE -- поиск обзорных и редакционных статей из общих журналов высокого качества, которые предоставляют полнотекстовый доступ;

National Guideline Clearinghouse -- практические руководства Агентства по исследованиям и качеству медицинского обслуживания США;

реферативная БД обзоров по эффективности медицинских вмешательств;

* MEDLINE -- поиск оригинальных исследований.

Для поиска в SUMSearch можно использовать следующие фильтры: Intervention, Prognosis, Diagnosis, Etiology/causation, Physical findings, Screening/Prevention, Adverse treatment effects TRIP

БД TRIP обеспечивает поиск по 75 сайтам, содержащим медицинскую информацию высокого качества. TRIP предоставляет прямой гипертекстовый доступ к крупнейшему собранию «научно обоснованных» материалов в Сети Интернет, а также к онлайновым статьям из таких ведущих журналов, как BMJ, JAMA, NEJM и др. Ежемесячно в базу добавляется около 300--400 статей.

Таблица 2. Основные сведения по источникам медицинской информации

Источник	Содержание
Журналы вторичной информации
АСР Journal Club	Рефераты статей с комментариями экспертов
Evidence-Based Medicine	Рефераты статей.
Evidence-Based Mental Health	Оригинальные и обзорные статьи по психиатрии
Evidence-Based Nursing	Критические резюме статей с комментариями практикующих медсестер
Международный журнал медицинской практики	Структурированные рефераты ключевых, важных для практикующих врачей клинических и эпидемиологических исследований с комментариями
BMJ Updates	Рассылка информации о новых публикациях по интересующей специальности. Доступ к резюме статей с 2002 года.
	БД первичной информации
MEDLINE	12 млн. статей, опубликованных с 1966 года
EMBASE	10 млн. статей, опубликованных с 1974года
БД вторичной информации
Кохрановская библиотека. (The Cochrane Library)	Содержит БД систематических обзоров; эффективности лечебных вмешательств; Регистр контролируемых КИ; методологии обзоров
UpToDate	Официальная образовательная программа с восьмью ведущими профессиональными медицинскими ассоциациями США
Clinical Evidence	Материал для разработки клинических рекомендаций
Международные сотрудничества
BEME Collaboration -- Best Evidence Medical Education	Систематические обзоры в области медицинского образования
Evidence for Policy and Practice Information and Coordinating Centre -- EPPI-Centre	Социологические исследования
Campbell Collaboration (C2)	Систематические обзоры исследований, посвященных различным мешательствам
Метапоисковые службы
SUMSearch	Поиск в: Merck Manual MEDLINE практические руководства (Агентство по исследованиям и качеству медицинского обслуживания) и реферативная БД обзоров по эффективности медицинских вмешательств
TRIP	Поиск по 75 сайтам, содержащим медицинскую информацию

Основы поиска доказательной информации в БД

Информационный поиск в области доказательной медицины требует использования системного подхода. Для успешного поиска необходимой информации по вопросам доказательной медицины большое значение имеют выбор соответствующих БД и применение оптимальной методологии поиска (использование рубрикации, поиск в определенных полях БД). Однако даже при самом тщательном и квалифицированном поиске не всегда удается найти необходимую информацию о проведенных КИ (например, из-за некачественного индексирования или нежелания фирм-спонсоров публиковать отрицательные результаты КИ). По этой причине при поиске доказательной информации компьютерный отбор необходимо дополнять другими методами поиска: «ручным» поиском информации о КИ, описание которых отсутствует в электронных БД; изучением списков литературы в найденных статьях; запросами исследователям и производителям ЛС.

Булева логика

Для проведения поиска в большинстве электронных БД необходимо использовать операторы булевой логики (Джордж Буль -- английский математик, 1815-1864 гг.): AND, OR, NOT.

В большинстве БД операторы булевой логики следует вводить верхнем регистре.

Оператор AND -- «и» обозначает, что будут найдены статьи содержащие оба термина. Например, при поиске статей по лапароскопической холецистэктомии надо написать следующий запрос: «laparoscopic AND cholecystectomy».

Оператор OR -- «или», то есть когда надо подобрать статьи, содержащие и один и второй (логически) связанные термины. Например, необходимо подобрать статьи о применении холецистэктомии и холецистостомии, то есть все статьи, в которых содержатся первый или второй термин. Запрос будет выглядеть следующим образом: «cholecystecomy OR cholecystostomy».

Оператор NOT -- «не». Когда надо исключить заведомо ненужные темы. Например, вы ищите информацию о лапароскопической холецистэктомии, но надо исключить все статьи о традиционной (лапаротомной) холецистэктомии. Запрос будет выглядеть так: «laparoscopic AND cholecystectomy NOT laparotomy».

Поля баз данных

Поиск в БД можно проводить в конкретном поле. Часто для поиска достаточно только внести термин и указать поле поиска при помощи соответствующего суффикса (аббревиатуры): год публикации, место публикации, поиск по авторам и т.д. Для обозначения полей используют суффиксы, которые используют при построении поисковых запросов. Синтаксис суффиксов может различаться в различных поисковых системах. Так, на сайте PubMed суффиксы следует вводить в квадратных скобах. Обычно на носителе или на сайте, на котором предоставляется MEDLINE-ссылка указана на полный перечень полей. На сайте PubMed предоставляется ссылка на файл помощи, с которым следует ознакомиться перед началом работы с этим сайтом.

Поле авторы -- [au]. Например, необходимы все статьи под авторством David S. А. Запрос будет выглядеть так: David SA [au]. Или все статьи о лапароскопической холецистэктомии под авторством David S. А. -- laparoscopic cholecystectomy, me AND David SA [au].

Поле [so]. Ограничение области поиска по месту публикации. Для того чтобы ограничить перечень изданий, на которые будут выдаваться ссылки при поиске, можно написать в запросе краткие обозначения соответствующих изданий. Например, если вы хотите найти все статьи о лапароскопической холецистэктомии в журнале Клиническая Медицина, необходимо сформировать следующий запрос: laparoscopic cholecystectomy [mh] AND (Klin-MedMosk) [so]. Где so - суффикс поля краткого названия журнала.

Поле [sb] (subset) -- фильтры подмножеств журналов, предметных областей, типов публикаций. Предлагается три основных подмножества журналов: AIM - предметная область примерно 120 ведущих журналов мира, перечисленных в списке Abridged Index Medicus; Nursing -- область библиографического справочника International Nursing Index (сестринское дело); Dental -- стоматология -- Index то Dental Litherature.

Чтобы сформировать запрос о поиске информации о лапароскопической холецистэктомии в основных журналах надо написать следующее: laparoscopic cholecystectomy [mh] AND AIM [sb].

Предметные области представлены в табл. 3.

Таблица 3. Предметные области в MEDLINE, для которых встроены специальные фильтры поиска

Название области	Перевод	Формулировка запроса
AIDS	СПИД	aids[sb]
Bioethics	Биоэтика	bioethics[sb]
Cancer	Рак	cancer[sb]
Complementary Medicine	Альтернативная медицина	cam[sb]
History of Medicine	История медицины	history[sb]
Space Life Sciences	Космическая медицина	space[sb]
Systematic Reviews	Систематические обзоры	systematic[sb]
Toxicology	Токсикология	tox[sb]

Поля [ti] (название) и [jn] (журнал). Если вы знаете название статьи (или приблизительное название) и, возможно, журнал, в котором она была опубликована, можно использовать ключи поиска по названию или журналу. Другие поля БД MEDLINE представлены в табл. 4.

Таблица 4. Основные поля БД MEDLINE

Поле	Содержание	Пример
[ab]	Реферат (абстракт)	measles[ab]
[ad]	Адрес авторов	St. petersburg[ad]
[ai]	Признак наличия реферата (содержит строку ab, если в записи есть реферат), никогда не выводится	asthma[ai]
[aid]	Идентификационный номер издателя Встречают два варианта -- Pll (controlled publisher identifier) и DOI (Digital Object Identifier)	S0140673699071482[aid]
[1au]	Первый автор	wong[1au]
[au]	Автор	wong[au]
[fau]	Полное имя автора	wong Julia s[fau]
[lastau]	Последний автор. Руководителей проектов нередко упоминают в конце списка	marsh[lastau]
[dp]	Дата публикации в формате: YYYY/MM/DD	1998/03/15[dp]
[edat]	Дата поступления публикации в PubMed	1997/10/06[edat]
[gr]	Номер контракта или гранта	ca101211[gr]
[issn]	Номер ISSN	0140-6736[issn]
[jn]	Название журнала	lancet[jn]
[lа]	Язык публикации. Указывают первые три буквы названия языка за некоторыми исключениями (японский - jpn [la]) Содержит кроме названия языка фразу NON ENGLISH, если язык публикации отличается от английского	chi[la]
[mh]	Это поле содержит списки ключевых слов MeSH, хар актеризующих данную публикацию, что позволяет найти ссылки, относящиеся к нужной теме, даже если она не упоминается в реферате или названии.	aromatherapy[mh]
[mhda]	Дата присвоения индексов MeSH	1997/12/18[mhda]
[ot]	Другой индексный термин, если статья проиндексирована в системе отличающееся от MeSH	demographic factors[ot]
[ps]	Имя собственное в качестве названия	nightingale f[ps]
[pt]	Тип публикации, например, journal article	review[pt]
[rn]	Регистрационный номер CAS или ЕС	1-5-20-4[rn]
[sb]	Фильтры выбранных областей	systematic[sb]
[sh]	Подрубрики MeSH, их использование описано ниже	toxicity[sh] dh [sh] = diet therapy [sh]
[si]	Вторичный источник данных -- ссылка на одну или несколько международных БД, например, HDB -- Hybridoma Data Bank	genbank/af001892[si].
[so]	Выходные данные	1999aug[so]
[tg]	Дополнительные признаки статьи, например, Case Report -- описание случая	case report[tg]
[ti]	Заголовок или его перевод на английский язык	common cold[ti]
[tiab]	Слово в заголовке и/или реферат	common cold[tiab]
[tt]	Оригинальный заголовок (если содержит перевод на английский язык). Название русскоязычных статей в транслите.	problema[tt]
[tw]	Слово в названии или аннотации	asthma[tw]
[pmid]	Код обновления PMID. Если он известен, то это самый быстрый способ найти ссылку.	10703801 [pmid]

Использование предметных рубрик системы индексации mesh при поиске статей в базе данных medline.

MeSH -- medical subject heading (медицинские предметные рубрики) -- список терминов (ключевых слов), при помощи которых индексируются статьи в БД MEDLINE. Подбор MeSH-термина или терминов можно сделать в два этапа. На первом этапе эмпирически подобрать термин, а затем посмотреть полученный результат в тех статьях, которые подходят, выбрать ключевые слова и использовать их в дальнейшем поиске. На втором этапе на сайте PubMed можно выбрать ссылку на базу ключевых слов MeSH и просмотреть иерархическое расположение термина и его подрубрики.

Для того чтобы использовать ключевые слова (MeSH), необходимо создать запрос по типу «ключевое слово из списка MeSH». Например, если вы ищите информацию о лапароскопической холецистэктомии, то ключевым словом будет -- laparoscopic cholecystectomy, и запрос будет выглядеть следующим образом: laparoscopic cholecystectomy [mh].

Символ «*» в MEDLINE (PubMed)

Символ «*» используют в двух вариантах.

Для поиска всех возможных окончаний слова, при этом число вариантов ограничивается 600, первыми найденными. Например, вариант «epidemiol*» уже дает более 410 вариантов, а при поиске «epid*» вариантов слова более 600.

В базе терминов MeSH символ «*» в начале слова означает, что данный термин описывает основное содержание статьи. Запрос «*epidemiology [mh]» означает поиск статей, где главная тема -- эпидемиология.

Использование суффиксов подрубрик MeSH

Один из способов конкретизировать поиск -- использование подрубрик системы MeSH. Подрубрики -- дополнительная надстройка системы индексирования в MEDLINE. При помощи подрубрик статьи в MEDLINE в зависимости от MeSH-термина могут быть классифицированы на этиологию, профилактику, лечение, побочные эффекты и т.д. Наиболее полезные подрубрики представлены в табл. 5.

Таблица 5. Наиболее часто используемые подрубрики MeSH

Суффикс	Значение	Пример
/ае	побочные эффекты	thalidomide/ae
/со	осложнения	measles/co
/ct	противопоказания	propranolol/ct
/di	диагноз	glioma/di
/dt	лекарственная терапия	depression/dt
/ed	образование	asthma/ed
/ер	эпидемиология	poliomyelitis/ep
/hi	история	mastectomy/hi
/nu	сестринское дело	cerebral palsy/nu
/og	организация/управление	health service/og
/pc	профилактика и контроль	influenza/pc
/px	психология	diabetes/px
/th	терапия	hypertension/th
/tu	терапевтическое использование (препарата)	aspirin/tu

Обратите внимание на то, что подрубрика /th относится к немедикаментозному лечению заболеваний, а подрубрика /dt означает лекарственную терапию. Подрубрику /tu используют исключительно для ЛС и она означает «терапевтическое применение чего-либо». Подрубрику /рх используют для непсихических заболеваний, как в этом примере -- diabetes/ рх = психология диабета.

Типы вопросов и стратегии поиска

Эффективный поиск в MEDLINE предполагает сочетание поиска по медицинским предметным рубрикам (ключевым словам) с поиском по словам из текста (слова, содержащиеся в названии и реферате статьи) -- только таким образом можно выбрать все публикации по интересующей вас теме.

Следующие простейшие варианты запросов в комбинации с ключевыми словами (например MeSH-терминами) могут быть использованы для таких типов эпидемиологических исследований в области изучения:

этиологии: Risk [tw];

диагностики: Sensitivity and specificity [mh];

прогноза: Cohort Studies [mh];

лечения: Clinical Trial [pt].

Ниже представлены более эффективные стратегии поиска в PubMed MEDLINE в зависимости от типа вопроса. Лечение Чтобы найти статьи по терапии:

введите название болезни (термин MeSH);

выберите подрубрики/th (therapy -- терапия), /dt (drug therapy --лекарственная терапия),/pc (prevention and control -- профилактика и контроль);

введите название воздействия (название ЛС) (термин MeSH);

и выберите подрубрику /tu (therapeutic use -- терапевтическое применение);

объедините результаты этих двух поисков оператором AND. Можно также присоединить (AND) к результатам рубрику MeSH

«double-blind method» (двойной слепой метод). Это ограничит ваш поиск исследованиями, использующими двойной слепой метод контроля, который наиболее надежен.

Диагностические исследования

Самый быстрый и эффективный путь поиска достоверных статей по диагностике состоит в том, чтобы в базе MeSH:

ввести диагноз и использовать соответствующий термин MeSH;

ввести название диагностического теста;

соединить результаты первого и второго списка AND;

затем объединить их с MeSH-рубрикой Sensitivity и Specificity. (AND).

Прогностические исследования

Эффективный механизм поиска прогностических исследований -- соответствующая рубрика Prognosis в MeSH.

Как правило, лучшая схема исследования для ответа на вопросы о прогнозах -- когортное исследование. Лучший способ поиска таких исследований -- использование рубрики MeSH Cohort Studies.

Оптимальная стратегия поиска исследований по прогнозам -- расширенный поиск по рубрикам Prognosis и Cohort Studies и объединение расширенного поиска по рубрике Prognosis и расширенного поиска по рубрике Cohort Studies с помощью оператора OR. В зависимости от типа интересующего вас прогноза для поиска можно использовать и другие термины (рубрики MeSH), например: Mortality-- смертность, Morbidity -- заболеваемость, Risk -- риск.

Исследования факторов риска

Наиболее тесно связана с исследованиями вопросов вреда и этиологии MeSH-рубрика Risk. В таких исследованиях почти всегда применяют метод когортных исследований (Cohort Study). Это означает, что наилучшая простая стратегия поиска состоит в том, чтобы провести поиск с вашей темой по рубрикам Risk и Cohort Study и затем объединить результаты, используя, оператор OR. информационный индексация база данный

Clinical Queries

Клинические запросы -- фильтры методологи эпидемиологических исследований/ На сайте PubMed расположена встроенная система фильтров Clinical Queries (рис. 1), разработанная на основе определенных стратегий и позволяющая проводить поиск исследований по этиологии, лечению, диагностики, прогнозу, а также клинических рекомендаций

Для того чтобы воспользоваться системой фильтров, необходимо указать один или несколько терминов, связанных операторами булевой логики, затем выбрать категорию, и отметить расширенный (чувствительный) или более узкий (специфичный) поиск.

ТИПЫ ИНФОРМАЦИОННЫХ РЕСУРСОВ

Типы информации можно классифицировать по разным критериям (по источникам, целевой аудитории, носителям). При выборе направления поиска ответа на клинический вопрос приходится учитывать много разных факторов. Например, с точки зрения достоверности информации, самым надежным источником является печатная медицинская литература, в том числе публикуемая параллельно на интернет-сайтах журналов. В последние годы для многих лучших журналов их интернет-версия стала основной и более полной, чем печатаемая на бумаге. Но, тем не менее, именно научные медицинские журналы остаются источником самой надежной доказательной информации. В медицинских журналах обычно описываются результаты последних исследований, и, как правило, они не содержат базовой учебной или процедурной информации.

«Серая» литература

Термин «серая» литература относится ко многим разновидностям информационных материалов, которые не обязательно являются общедоступными и выпускаются государственными или частными организациями, для которых выпуск литературы не является основным видом деятельности. Это могут быть доклады, брошюры, инструкции, диссертации, информация о продукции, памятные записки, бюджетные данные, материалы исследований и другие документы, иногда не предназначенные для широкого распространения.

Доступ к «серой» литературе через обычные каналы литературы получить нелегко, так что такую литературу трудно обнаружить и получить. Как правило, литература такого типа не включается в обычные коммерческие БД, такие как Medline. Несмотря на то, что такая литература публикуется и рецензируется достаточно редко, она может содержать ценную информацию. «Серая» литература - пример ценного вида информации, имеющейся на Web-узлах.

Рецензированная информация

Процесс рецензирования представляет собой процедуру контроля качества и одновременно оценки рукописей на предмет публикации, заявок на гранты, на предмет финансирования, обзоров клинической эффективности и др. Рецензирование имеет целью получение объективного мнения экспертов в ходе анализа таких характеристик как наличие или отсутствие ошибок, достоверность, точность, организация исследования, научный вклад. Между представлением рукописи для публикации и собственно публикацией проходит некоторое время, необходимое для рецензирования. Процесс рецензирования в разных изданиях протекает по-разному, в том числе и с разной степенью строгости. Такой объективный экспертный анализ информации имеет существенное значение для обеспечения ее достоверности. Если информация должна использоваться в клинических условиях, то очень важно, чтобы она была отрецензированной. Главным источником рецензированной информации являются научные медицинские журналы. Их даже специально называют рецензируемыми (peer reviewed), чтобы подчеркнуть, что для печати отбираются только те, которые одобрили коллеги-рецензенты. Рецензируемой литературе противостоит «желтая» литература -журналы, издаваемые на деньги рекламодателей, обычно распространяемые бесплатно или по очень низкой цене. Такие журналы обычно содержат информацию, искаженную в пользу рекламодателя. Врачи - сторонники научно обоснованной практики рекомендуют не читать таких журналов вовсе, поскольку выделить истинную информацию из рекламных утверждений крайне сложно.

Отличия электронной информации от печатной

Развитие информационных технологий решающим образом повлияло на скорость и эффективность распространения информации. Электронные публикации имеют много преимуществ по сравнению с традиционными публикациями на бумаге. Однако, поскольку они появились сравнительно недавно, то они пока имеют и существенные недостатки.

Основной недостаток большинства электронных публикаций интернета (не путать с сайтами научных журналов) связан с отсутствием надлежащего рецензирования. Процесс публикации теперь не ограничен большими профессиональными сообществами или крупными издательствами, в которых существует стабильная и строгая система рецензирования. Электронные публикации могут осуществляться даже отдельными лицами, что ведет к распространению ошибочной информации. Высокая эффективность электронных публикаций увеличила функциональность информации и ее доступные объемы. Информация, опубликованная в электронной форме, может быть интерактивной или мультимедийной, что для печатной формы вообще неосуществимо. Применительно к документам на Web-узлах, издателям нравится, что они могут немедленно исправлять ошибки, а не ожидать следующего выпуска, чтобы поместить в нем список опечаток, как это происходит в печатных изданиях. Еще одно серьезное преимущество информации в электронной форме - то, что в ней легко организовать поиск, как в БД. Это верно независимо от того, находится ли информация в сочетании со специальным механизмом поиска на компакт-диске или она опубликована в World Wide Web, которая в этом случае является просто очень большой базой библиографических данных (если освоить существующие в ней механизмы поиска).

Стандартные компоненты статьи:

заглавие,

список авторов,

реферат,

введение,

обоснование исследования,

методика,

статистический анализ данных,

результаты исследования,

обсуждение,

литература.

Заглавие

В хорошем заглавии содержится большая часть содержания статьи. Если заголовок Вам интересен, смотрите далее на список авторов. Изредка в этом списке Вы увидите фамилию знакомого Вам автора, и это определит внимание к статье. Чаще всего имена неизвестны, значит надо двигаться дальше, т.е. читать реферат.

Реферат готовит автор статьи, он должен быть информативным, структурированным, с четко обозначенными разделами, отражающими содержание статьи.

Реферат должен содержать описание типа исследования и краткую формулировку результатов. Не пытайтесь извлечь из реферата большего. Обычно это невозможно даже в тех журналах, в которых рефераты имеют стандартизированную структуру и хорошо написаны. В журналах, где рефераты не помещают (или помещают плохие), следует заглянуть в конец статьи - нет ли там заключения или выводов? Они могут заменить реферат. Полезны ли они, интересны ли они Вам? Если Вы - врач амбулаторного уровня, а статья посвящена больным в специализированном стационаре, то вряд ли можно перенести результаты такой статьи на Вашу практику.

Введение

Введение нужно для ознакомления читателя с изучаемой проблемой и обоснования необходимости исследования. Здесь даются описание истории проблемы и формулировка цели исследования. Формулировка цели должна содержать полный ответ на вопрос - «Что надо изучить, у каких лиц, и каким методом?».

Если Вы решили читать дальше - переходите к разделу «Методы». В действительности, «Методы» включают в себя целый ряд аспектов организации и проведения исследования, и их не следует сразу изучать детально. В зависимости от содержания статьи и Вашей цели, пользуясь алгоритмом оценки, найдите ответ на главные, ключевые вопросы, вынесенные в раздел 2.6.2. Только получив утвердительный ответ на них, приступайте к более детальному чтению. Отрицательный ответ означает, что статья не соответствует основному критерию высокого методологического качества.

Обоснование исследования

Этот раздел является главным и в то же время самым трудным для чтения. Именно в нем излагаются сведения, которые позволяют выявить сильные и слабые стороны исследования, возможности применения его результатов.

Общеизвестно, что только эксперимент может показать, что в науке истинно. Чем тщательнее он поставлен, тем выше вероятность, что его результаты обусловлены реально существующей связью между явлениями, а не артефактом и не случайным стечением обстоятельств. «Вес» каждого факта тем больше, чем строже научная методика исследования, в ходе которого факт получен.

Методика исследования

Методы исследований в медицине являются объектом изучения науки эпидемиологии. В постсоветских странах эпидемиология понимается как наука о распространении инфекционных заболеваний. В медицинских статьях он часто оказывается неполноценным. Неполное описание методов исследования - достаточное основание для скептического отношения к статье в целом. Классическое научное исследование строится таким образом, чтобы устранить влияние всех случайных факторов.

Раздел «Методы» должен содержать только ту информацию, которая была доступна во время написания плана или протокола исследования. Вся информация, полученная во время проведения исследования, относится к разделу «Результаты».

Должно быть подробно описано, как отбирались участники наблюдений или экспериментов (больные или лабораторные животные, в том числе и контрольные группы), включая критерии включения и исключения из исследования, а также описание исследуемой популяции. В силу того, что отношение таких показателей как возраст и пол к цели исследования не всегда ясно, авторы должны обосновать их использование, если эти показатели упоминаются в описании исследования. Например, авторы должны объяснить, почему только объекты определенного возраста были включены в исследование, или почему женщины исключены из него. Ведущим принципом должна быть ясность и четкость изложения того, как и почему исследование проводили определенным образом. Если авторы упоминают расовую или этническую принадлежность, они должны указать, как измерялись эти показатели и обосновать их значимость.

Статистика

Статистические методы должны быть описаны настолько детально, чтобы знающий читатель, имеющий доступ к исходным данным, мог проверить представленные результаты. В данном разделе должны присутствовать как сами количественные данные, так и соответствующие ошибки измерения или неопределенности (такие, как доверительные интервалы). Также должно быть указано, какое программное обеспечение было использовано.

Результаты

Лучше всего представлять результаты в тексте, таблицах или рисунках в логической последовательности, начиная с основных или наиболее важных сведений. Дополнительные материалы и технические подробности можно представить в приложении, где они будут доступны и, в то же время, не будут прерывать структуры текста. При суммировании данных в разделе «Результаты» цифровые результаты даются не только в виде производных (например, процентного соотношения), но и в виде абсолютных чисел, на основе которых были рассчитаны эти производные, а также указываются, какие статистические методы использовались для их анализа.

Обсуждение

Выводы должны быть четко связаны с целями исследования и полностью подтверждены полученными данными.

Список литературы

Хотя ссылки на обзорные статьи могут быть эффективным способом в направлении читателей к основной литературе, по возможности, читателям должны быть даны ссылки на первоисточники, описывающие данное исследование. С другой стороны, большие списки ссылок на оригинальные работы по представленной тематике будут занимать чрезвычайно много места в печатной версии.

Критическая оценка публикаций

Для современного врача навыки критической оценки публикаций важны и необходимы, т.к. ежегодно публикуются результаты сотен исследований, которые меняют устоявшиеся стандарты врачевания. Часто в поисках ответа на клиническую проблему можно найти разнообразные, порой взаимоисключающие факты и рекомендации. Поэтому один из важнейших принципов доказательной медицины связан с критическим анализом информации: «вес» каждого факта тем больше, чем строже научная методика исследования, в ходе которого факт получен.

Другая, не менее важная задача при критической оценке публикации состоит в том, чтобы определить, в какой степени ее результаты можно распространить на конкретную клиническую ситуацию (так называемая «обобщаемость» исследования).

Нередко врачи склонны расширенно трактовать результаты публикаций. Между тем, неправомерно переносить на человека результаты, полученные на экспериментальных животных, а результаты обследования узко ограниченной группы больных - на пациентов, отличающихся по возрасту или степени тяжести заболевания, или же распространять данные об эффективности конкретного препарата на всю лекарственную группу.