Последний в Европе крупный естественный комплекс низинных болот, рек, протоков и пойменных лесов с таким уровнем биоразнообразия, КОТ и Рамсарское угодье. 64% территории находится в пользовании 34 колхозов. В самом заказнике основными видами деятельности являются сенокошение и выпас скота (14% площади), но на минеральных островах и небольших участках внутри заказника ведется распашка земель. 27% территории используется в лесном хозяйстве. Оставшаяся площадь не используется. Прилегающие земли используются, в основном, для пахотного земледелия.

На территории заказника сконцентрированы все типичные для Полесья и ставшие редкими в Беларуси и Европе биотопы -- спелые пойменные дубравы, низинные болота, разнообразнейшие пойменные луга, водно-болотные угодья. Наличие этих уникальных биотопов обусловило сохранение ряда редких видов фауны и флоры и особенно птиц (в заказнике можно наблюдать в естественных условиях жизнь 5 глобально угрожаемых и 52 видов пернатых, внесенных в Красную Книгу Беларуси).

В заказнике произрастает 725 видов растений. В составе фауны наземных позвоночных зарегистрировано 36 видов млекопитающих (лось, кабан, косуля, лиса, волк, енотовидная собака, бобр), 182 вида птиц, 6 рептилий, 10 -- амфибий и 37 видов рыб.

Пойма реки Припять имеет международное значение с точки зрения сохранения популяций целого ряда редких и исчезающих в Европе видов фауны: белоглазый нырок, большой подорлик, коростель, дупель, вертлявая камышевка, черный аист, гуменник, белолобый гусь, связь, серая утка, черная крачка, филин, болотная сова, погоныш, серая неясыть и т. д.

- заказник является хорошим примером равнинных пойм рек, характерных для биогеографического региона Полесье;

- участок поймы реки Припять имеет важнейшее значение для поддержания гидрологических и биологических функций в бассейне трансграничной реки Днепр;

- в пойме отмечено пребывание 52 видов птиц, занесенных в Красную книгу Беларуси, 39 из которых гнездится в пойме;

- территория заказника поддерживает пребывание на ней более 20,000 водоплавающих птиц;

- здесь гнездится более чем 1% Европейских популяций большой выпи, черного аиста, чирка-трескунка, серой утки, черной крачки, белокрылой крачки;

- пойма играет важнейшую роль как место основных нерестилищ многих видов рыб в Полесском регионе.

В пределах заказника «Средняя Припять», для которого характерно наличие огромных болотных массивов, выделяются два вида ландшафтов:

- пойменные ландшафтные комплексы с низинными болотами и черноольховыми лесами;

- плоско-гривистые ландшафты с лугами, дубравами и разнотравно-осоковыми болотами.

Река Припять является главной артерией крупного региона Припятское Полесье. От состояния гидрологического режима этой реки и ее притоков зависит уровень грунтовых вод во всем регионе. Сохранение и восстановление естественного гидрологического режима реки и ее притоков позволит нормализовать сложную экологическую обстановку в Полесье, которая сложилась в результате крупномасштабной осушительной мелиорации более 1 млн. га территории водосбора реки Припять, проведенной в 60-х -90-х годах прошлого века.

Площади, занятые естественной растительностью (лесами, луга и болота занимают около 92% территории заказника: занято около 23% территории, составляют 38%, кустарники - около 12%, и водные угодья - около 6%.

В структуре лесов заказника хорошо представлено разнообразие лесного покрова геоботанического района в целом - здесь насчитывается 66 типов леса 10 формаций. По сравнению с геоботаническим районом пойма отличается прежде всего наличием большого количества дубрав и черноольшаников и, наоборот, малой площадью - сосновых лесов и производных мелколиственных. Повышенной долей на территории заказника по отношению к геоботаническому району отличаются такие редкие для подзоны в целом сообщества граба, клена, липы, вяза. Леса поймы Припяти выгодно отличаются от большинства территорий, не имеющих особого охранного статуса, высокой насыщенностью высоковозрастных дубрав, ясенников, черноольшаников. 52% лесов заказника приходится на наиболее ценные древостои спелые дубравы, грабняки, черноольшаники Основной проблемой Припятских лесов является нарушение гидрологического режима в результате чего вымокают пойменные леса. Господствующим типом растительности в пределах заказника являются луга. Они занимают более половины его территории. В этом отличительная особенность всего Полесского региона от остальной территории Беларуси. Территория заказника «Средняя Припять» может служить эталоном естественных низинных и пойменных лугов. Длительное затопление поймы р. Припять и единообразие ее рельефа - выравненность и заболоченность, обусловили небольшое фитоценотическое разнообразие. Однако здесь произрастают уникальные и редкие для Беларуси сообщества, которые благодаря специфике почвообразующих пород и гидрологического режима территории получили широкое распространение - широко представлены болотные сообщества и сообщества сырых лугов.

В последние годы происходит зарастание открытых пойменных лугов и низинных болот кустарниками, которое обусловлено тем, что местное население перестало косить труднодоступные участки поймы, а использует для добычи сена доступные для техники мелиорированные территории.

Растения. На территории заказника «Средняя Припять» зарегистрировано 725 видов растений. Для поймы средней Припяти характерна высокая степень естественности флоры, которая связана с труднодоступностью поймы и ее слабой освоенностью из-за продолжительных паводков и отсутствия дорог: пойменные луга в лучшем случае использовались как пастбища и сенокосные угодья, что не оказывало существенного влияния на состав и степень сохранности естественной флоры. В пределах заказника выявлено 11 видов растений, внесенных в Красную книгу, ряд уникальных видов ранее неизвестных для Припятского региона, например, камнеломка трехпальцевая, фиалка прудовая, сердечник мелкоцветковый.

Намного лучше сохранились в пойме Припяти лесные участки, где выявлено 6 охраняемых видов. Некоторые находки являются уникальными - самыми южными или носящими островной характер.

Ценная фауна: Богатство фауны на территории заказника обусловлено высоким ландшафтным разнообразием, создающих высокое разнообразие местообитаний. Это естественные низинные болота; густая сеть пойменных озер и временных паводковых водоемов; русла рек и песчаные дюны; влажные, заболоченные и остепненные пойменные луга; различные пойменные леса, кустарники.

Всего в составе фауны наземных позвоночных животных в границах заказника зарегистрировано 36 видов млекопитающих, 182 вида птиц, 6 - рептилий, 10 - амфибий и 37 видов рыб.

Млекопитающие. Наибольшее значение пойма Припяти имеет для поддержания популяций околоводных видов. Здесь располагаются крупнейшие в Беларуси воспроизводственные центры бобра, выдры, американской норки, лесного хоря. Заболоченные леса и кустарники служат местом концентрации в регионе лося, кабана. Птицы. По сравнению с другими наземными позвоночными, фауна птиц на территории заказника характеризуется наибольшим разнообразием. Здесь отмечено 155 гнездящихся видов, что составляет более 68% от всего состава гнездящихся птиц Беларуси, показатель является самым высоким среди охраняемых территорий Беларуси.

За весь период наблюдений в пойме отмечено пребывание 52 видов птиц, занесенных в Красную книгу Беларуси, 39 из которых гнездится в пойме. Состояние белорусских популяций 14 видов-краснокнижников полностью определяется состоянием поймы Припяти. 30-100% численности этих видов гнездится на территории заказника: малая выпь, кваква, большая белая цапля, черный аист, шилохвость, белоглазая чернеть, большой подорлик, малый погоныш, галстучник, мородунка, варакушка, обыкновенный ремез, белая лазоревка.

Пойма реки Припять имеет международное значение для сохранения популяций целого ряда редких и исчезающих видов Европы. Наибольшая значимость данной территории состоит в том, что здесь постоянно и в достаточно большом количестве обитают следующие глобально угрожаемые и приравниваемые к ним виды птиц: вертлявая камышевка (150-400), большой подорлик Aquila clanga (15 пар), коростель (500-2000), дупель (50), спорадически гнездится белоглазая чернеть, останавливается в период весенней миграции пискулька.

Пойма Припяти имеет также большое значение для сохранения целого ряда других видов птиц, объявленных угрожаемыми в Европе, поскольку именно на этом участке поймы сконцентрированы их основные местообитания, исчезнувшие или исчезающие во всей Европе: низинные осоковые и тростниковые болота, обширные заливные луга, пойменные дубравы. Здесь гнездится более 1% европейской популяции большой выпи (300 самцов), черного аиста (50-70 пар), черной крачки (500-1000 пар). На территории планируемого заказника обитает более 1% республиканской популяции 27 видов птиц.

Территория поймы Припяти является крупнейшим местом размножения для охотничьих видов водоплавающих птиц Беларуси: кряквы, серой утки, чирка-трескунка, широконоски, а в годы с продолжительным весенним паводком - для красноголовой чернети и лысухи.

Пойма Припяти имеет международное значение для ряда водно-болотных видов птиц и в период весенней миграции. Полесская низменность является крупнейшим в Европе руслом весенней миграции птиц, осью которого является пойма реки Припять. Этот миграционный путь совпадает с границами нескольких крупных оледенений и сформировался, вероятно, под их влиянием еще в эпоху плейстоцена. Его направление с запада на восток отличается от общего северного и северо-восточного направления миграций большинства сухопутных видов птиц, мигрирующих в Восточной Европе широким фронтом. Общая численность мигрирующих вдоль поймы реки Припять гусей составляет по предварительным оценкам около 50 тыс, свиязи Anas penelope - 30 тыс.

Этот участок поймы Припяти благоприятен и для различных видов амфибий и рептилий. Здесь отмечено обитание почти всех видов герпетофауны Беларуси (16 видов). Среди них редкие виды болотная черепаха, камышовая жаба, квакша обыкновенная.