Защита фармацевтических патентов

Онтология охватывает три ключевых типа изобретения, соответствующие основным онтологическим классам, описывающим изобретение - Продукт, Способ производства и Применение. Помимо класса Изобретение, онтология также включает в себя ряд дополнительных классов, позволяющих с достаточной полнотой моделировать содержание патента. Среди дополнительных классов стоит перечислить, например, класс Лекарственное средство, описывающий существующие на рынке фармацевтические препараты; класс Состояние здоровья, включающий в себя заболевания; класс Вещество, играющий важную роль при определении объектов Изобретение и Лекарственное средство. Помимо ключевых классов и их определений, онтология также включает в себя более 30 типов связей, разрешённых между классами. Эти онтологические связи обогащают общую схему и позволяют с помощью неё отвечать на пользовательские запросы о фармакологических преимуществах нового вещества по сравнению с его известным аналогом или о дозировках действующих веществ, входящих в патентуемую композицию.

Онтология учитывает правовые аспекты защиты различных типов фармацевтических изобретений. Так, например, в онтологии противопоставлены изобретения, подпадающие под абсолютную и прямую защиту, и косвенные методы патентования. Кроме того, в онтологии проводится разграничение между новым знанием (то есть, самим изобретением) и известной информацией, что позволяет более точно описывать новизну и изобретательский уровень объекта патентования и проводить сравнение изобретения с известным уровнем техники.

Онтология разрабатывалась для применения в узкой сфере, а именно для анализа патентного ландшафта в фармацевтике, однако стоит отметить, что при этом способность онтологии к интеграции с другими ресурсами сохраняется в значительной степени: термины в онтологии носят универсальный характер и имеют отсылки к другим ресурсам.

Онтология разрабатывалась с учётом множества классификаций в сфере интеллектуальной собственности и потому может служить в качестве источника, объединяющего различные взгляды.

Определения онтологии были оценены по критериям точности, полноты и непротиворечивости. Кроме того, описаны основные запросы, на которые может отвечать онтология.

В дальнейшем планируется продолжить расширение классов онтологии, уточнение значений. В частности, более подробно может быть смоделирован класс Новая лекарственная форма и Новая система доставки лекарственного средства, также в онтологию могут быть добавлен способ подробного описания фармакологических свойств действующих веществ. Онтология может быть также расширена за счёт увеличения количества типов изобретений, например, в неё может быть включен не только класс патентов АК61, но и класс A61J - «Упаковки и сосуды, специально предназначенные для медицинских или фармацевтических целей; способы и устройства, специально предназначенные для придания лекарственным препаратам определенной физической или иной, удобной для употребления формы; приспособления для введения пищи или лекарственных препаратов перорально; соски-пустышки; приемники для мокроты». В целом, онтология создавалась для многократного использования и позволяет итеративный процесс улучшения в дальнейшем.

Литература

1. Аладышева, Латынцев 2015 - Ж.И. Аладышева, А.В. Латынцев. Особенности защиты интеллектуальной собственности при обращении лекарственных средств и медицинских изделий. // Ремедиум. Журнал о рынке лекарств и медицинской техники 4, 2015. C. 65-70.

2. Игнатов, Серова 2017 - М.Е. Игнатов, М.А. Серова. Некоторые аспекты правовой охраны изобретений в области фармацевтики и медицины в Евразийском патентном ведомстве // Патенты и лицензии, 1, 2017. С. 58-59.

3. Пигарева 2014 - Е. Пигарева Особенности патентования ЛС в РФ // Московские аптеки 3, 2014.

4. Попов 2009 - Д. Попов Плоды патентной глобализации. // Ремедиум, 2009. С. 6-7.

5. Сергеев, Фарбер 2014 - Ю.Д. Сергеев, Е.В. Фарбер. ЛС как объекты гражданских прав // Медицинское право, 2, 2014. С: 3-9.

6. Грицанов 1998 - А.А. Грицанов (ред.). Новейший философский словарь. - Мн.: Изд. В.М. Скакун, 1998. - 896 с.

7. Маннинг и др. 2011 - К.Д. Маннинг, П. Рагхаван, Х. Щютце. Введение в информационный поиск.: Пер. с англ - М.: ООО «И.Д. Вильямс», 2011.

8. Челышева 1996 - О.В. Челышева. Патенты на химические соединения: объем прав и их нарушение. - ИНФРА-М, 1996. - 64 с.

9. Ashburner et al. 2000 - M. Ashburner, C.A. Ball CA, J.A. Blake, D. Botstein, H. Butler, J.M. Cherry. Gene ontology: Tool for the unification of biology // Nature Genetics 25 (1), 2000. P. 25-29.

10. Blackman 1995 - M. Blackman, Provision of patent information: a national patent office perspective // World Patent Information 17 (2) 1995. P. 115-123.

11. Burgunder 1995 - L.B. Burgunder. Legal Aspects of Managing Technology. South-Western Publishing Company 1995.

12. Demner-Fushman, Lin 2007 - D. Demner-Fushman, J. Lin. Answering clinical questions with knowledge-based and statistical techniques // Computational Linguistics 33 (1), 2007. P. 63-103.

13. Gassman, Reepmeyer 2008 - O. Gassmann; G. Reepmeyer, M. von Zedtwitz. Leading Pharmaceutical Innovation: Trends and Drivers for Growth in the Pharmaceutical Industry. Springer, Berlin, 2008.

14. Grabowski 2002 - H.G. Grabowski, Patents and New Product Development in the Pharmaceutical and Biotechnology Industries // J.V. Duca, M.K. Yticel (eds) Science and Cents: Exploring the Economics of Biotechnology: Proceedings of the 2002 Conference on Exploring the Economics of Biotechnology. P. 87-104.

15. Grandstand 1999 - O. Granstand. The Economics and Management of Intellectual Property: Toward Intellectual Capitalism. Edward Elgar Publishing, Cheltenham 1999.

16. Gruber 1995 - T.R. Gruber. Toward Principles for the Design of Ontologies Used for Knowledge Sharing // International Journal of Human-Computer Studies, 43, 1995. P. 907-928.

17. Gruninger 1996 - T. Gruninger. Ontologies: Principles, methods and applications // The Knowledge Engineering Review. 11 (2), 1996. P. 93-155

18. Hamosh et al. 2005 - A. Hamosh, A.F. Scott, J.S. Amberger, C.A. Bocchini, V.A. McKusick. Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM), a knowledgebase of human genes and genetic disorders. // Nucleic Acids Research, 37, 2005 (Database Issue): D793-D796.

19. He et al. 2014 - Y. He, S. Sarntivijai, Y. Lin, Z. Xiang, A. Guo, S. Zhang, D. Jagannathan, L. Toldo, C. Tao, B. Smith. OAE: The Ontology of Adverse Events. // Journal of Biomedical Semantics 5, 2014. P: 5:29.

20. Kan et al. 2001 - M.-Y. Kan, K.R. McKeown, J.L. Klavans. Domain-specific informative and indicative summarization for information retrieval // Proceedings of the Document Understanding Workshop, 2001, New Orleans.

21. DiMasi, Grabowski 2012 - J.A. DiMasi, H.G. Grabowski. R&D Costs and returns to new drug development: a review of the evidence. // P.M. Danzon, S. Nicholson (eds.) The Oxford Handbook of The Economics of the Biopharmaceutical Industry. Oxford, UK: Oxford University Press, 2012. P. 21-46.

22. Donnelly 2006 - K. Donnelly. SNOMED-CT: The advanced terminology and coding system for eHealth // Studies in Health Technology and Informatics 121, 2006. P. 279-90.

23. Hafner et al. - C. Hafner, K. Baclawski, R. Futrelle, N. Fridman, S. Sampath. Creating a knowledge base of biological research papers // 2nd International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, 1994. P. 147-155.

24. Kuhlik 2004 - B.N. Kuhlik. The Assault on Pharmaceutical Intellectual Property // The University of Chicago Law Review, 71 (1), 2004. P.93-109.

25. Kibbe et al. 2015 - W.A. Kibbe, C. Arze, V. Felix, E. Mitraka, E. Bolton, G. Fu, C.J. Mungall, J.X. Binder, J. Malone, D. Vasant, H. Parkinson, L.M. Schriml. Disease Ontology 2015 update: an expanded and updated database of human diseases for linking biomedical knowledge through disease data. // Nucleic Acids Research 43, 2015 (Database Issue): D1.

26. Kiriyama 2011 - N. Kiriyama. Trade and Innovation: pharmaceuticals // OECD Trade policy working paper 113, 2011. P. 43.

27. Kiss et al. 2012 - M. Kiss, Б. Nagy, V. Vincze, A. Almбsi, Z. Alexin. A Manually Annotated Corpus of Pharmaceutical Patents // Text, Speech and Dialogue. Springer Berlin Heidelberg, 2012. P. 135-142.

28. Donaldson et al. 2003 - I. Donaldson, J. Martin, B. de Bruijn, C. Wolting, V. Lay, B. Tuekam, S. Zhang, B. Baskin, G. Bader, K. Michalickova, T. Pawson, C. Hogue. PreBIND and Textomy - mining the biomedical literature for protein-protein interactions using a support vector machine. // BMC Bioinformatics 4 (11), 2003.

29. Larkey 1999 - L. Larkey. A Patent Search and Classification System. ACM New York, 1999. P. 179-187.

30. Lee et al. 2011 - C. Lee, J. Jeon, Y. Park, Monitoring trends of technological changes based on the dynamic patent lattice: a modified formal concept analysis approach // Technological Forecasting and Social Change 78 (4), 2011 P. 690-702.

31. Lee et al. 2015 - C. Lee, B. Kan, J. Shin. Novelty-focused patent mapping for technology opportunity analysis // Technological Forecasting and Social Change 90, 2015. P. 355-65.

32. Lipscomb 2000 - C.E. Lipscomb. Medical Subject Headings (MeSH) // Bulletin of the Medical Library Association 88 (3), 2000. P. 265-266.

33. Marinescu et al. 2002 - M. Marinescu, M. Markellou, G. Mayritsakis, K. Perdikuri, S. Sirmakessis, A. Tsakalidis. Knowledge Discovery in Patent Databases // Proceedings of ACM Conference of Information and Knowledge Management, 2002.

34. Musen 2002 - A.M. Musen Medical informatics: searching for underlying components // Methods of Information in Medicine 41, 2002. P. 12-9.

35. Nelson et al. 2011 - S.J. Nelson, K. Zeng, J. Kilbourn, T. Powell, R. Moore. Normalizied names for clinical drugs: RxNorm at 6 years // Journal of the American Medical Informatics Association, 18 (4), 2011. P. 441-448.

36. Osbosn et al. 1997 - M. Osborn, T. Strzalknowski, M. Marinescu. Evaluating Document Retrieval in Patent Database: A Preliminary Report // Proceedings of ACM Conference of Information and Knowledge Management, 1997.

37. Rodriguez-Esteban, Bundschus 2016 - R. Rodriguez-Esteban, M. Bundschus. Text mining patents for biomedical knowledge // Drug Discovery Today 21 (6), 2016. P: 997-1002.

38. Rosse, Mejino 2003 - C. Rosse, J.V.L. Mejino. A reference ontology for biomedical informatics: the Foundational Model of Anatomy // Journal of Biomedical Informatics 36, 2003. P. 478-500

39. Smith et al. 2007 - B. Smith, M. Ashburner, C. Rosse, J. Bard, W. Bug, W. Ceusters, S. Lewis. The OBO Foundry: Coordinated evolution of ontologies to support biomedical data integration. // Nature Biotechnology 25 (11), 2007. P. 1251-1255.

40. Schriml et al. 2012 - L.M. Schriml, C. Arze, S. Nadendla, Y.W. Chang, M. Mazaitis, V. Felix, G. Feng, W.A. Kibbe. Disease Ontology: a backbone for disease semantic integration. // Nucleic Acids Research 40, 2012, (Database Issue): D1.

41. Uschold, King 1995 - M. Uschold, M. King. Towards a Methodology for Building Ontologies. // D. Skuce (ed.), Workshop on Basic Ontological Issues in Knowledge Sharing, Montreal, Canada, 1995. P. 163.

42. Vita et al. 2010 - R. Vita, L. Zarebski, J.A. Greenbaum, H. Emami, I. Hoof, N. Salimi, R. Damle, A. Sette, B. Peters. The Immune Epitope Database 2.0 // Nucleic Acids Research 38, 2010 (Database Issue): D854-D862.

43. Lehman 2003 - B. Lehman. The Pharmaceutical Industry and the Patent System (электронный документ). https://users.wfu.edu/mcfallta/DIR0/pharma_patents.pdf (дата обращения: 29.04.2017). 2003.

44. Rodriguez-Esteban 2009 - R. Rodriguez-Esteban. Biomedical text mining and its applications (электронный документ). PLoS Computational Biology 5 (12), 2009. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2791166/ (дата обращения: 29.04.2017)

45. Trippe 2015 - A. Trippe. Guidelines for Preparing Patent Landscape Reports (электронный документ). http://www.wipo.int/edocs/pubdocs/en/wipo_pub_946.pdf (дата обращения: 29.04.2017). 2015

46. Tcheremenskaia et al. 2012 - O. Tcheremenskaia, R. Benigni, I. Nikolova, N. Jeliazkova, S.E. Escher, M. Batke, T. Baier, V. Poroikov, A. Lagunin, M. Rautenberg, B. Hardy. OpenTox predictive toxicology framework: toxicological ontology and semantic media wiki-based OpenToxipedia (электронный документ). Journal of Biomedical Semantics (3). http://bio-ontologies.knowledgeblog.org/187 (дата обращения: 29.04.2017). 2012

47. Atkinson et al. 2012 - A. Atkinson, Jr., S.-M. Huang, J. Lertora, S. Markey (eds.). Principles of Clinical Pharmacology. Third Edition. Academic Press, Elsevier, 2012.

48. Allemang, Hendler 2011 - D. Allemang, J. Hendler. Semantic web for the working ontologist modeling in RDF, RDFS and OWL. Elsevier, 2011.

49. Cohen, Demner-Fushman 2014 - K.B. Cohen, D. Demner-Fuschman. Biomedical Natural Language Processing. - John Benjamins Publishing Co, 2014. - 160 p.

Размещено на Allbest.ru