Разработка модифицированных генетических операторов для задачи разбиения СБИС (сверхбольшая интегральная схема)
Генетический алгоритм как адаптивный поисковый метод, который основан на селекции лучших элементов в популяции. Языковая конструкция, позволяющая на основе преобразования (скрещивания) хромосом родителей (или их частей) создавать хромосомы потомков.
Рубрика | Биология и естествознание |
Вид | статья |
Язык | русский |
Дата добавления | 19.01.2018 |
Размер файла | 734,1 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Размещено на http://www.allbest.ru/
Разработка модифицированных генетических операторов для задачи разбиения СБИС**Теоретические и практические результаты работы использованы в госбюджетных и хоздоговорных работах, проводимых в Таганрогском Технологическом Институте Южного Федерального Университета: грант РФФИ № 01-01-00044 "Эволюционное проектирование с адаптацией"; грант РФФИ на проведение фундаментальных исследований в области технических наук № 02-01-01275 "Разработка теории и принципов эволюционного проектирования на основе многоагентных подходов"; госбюджетная работа по заказу Минобразования РФ "Разработка теории и принципов построения интеллектуальных систем автоматизированного проектирования на основе эволюционной адаптации, нейросетевых моделей и методов принятия решений".
Баринов С.В.
Генетический алгоритм (ГА) представляет собой адаптивный поисковый метод, который основан на селекции лучших элементов в популяции, подобно эволюционной теории Ч. Дарвина [1]. Впервые такие алгоритмы были применены к проблеме распознавания образов.
Основой для их возникновения послужили модель биологической эволюции и методы случайного поиска.
Приведем некоторые понятия и определения из теории ГА. Все ГА работают на основе начальной информации, в качестве которой выступает популяция альтернативных решений Р. Популяция - это множество элементов Pi, n - размер популяции. Каждый элемент популяции Р, как правило, представляет собой альтернативное упорядоченное или неупорядоченное решение - особь. Особь состоит из одной или нескольких хромосом. В работе автором под термином "особь" понимается однохромосомное альтернативное решение [2].
Генетический оператор - это средство отображения одного множества на другое. Другими словами, это конструкция, представляющая один шаг из последовательности действий генетического алгоритма, описанного посредством некоторого языка.
Оператор кроссинговера (ОК) - это языковая конструкция, позволяющая на основе преобразования (скрещивания) хромосом родителей (или их частей) создавать хромосомы потомков. Оператор мутации(ОМ) - это языковая конструкция, позволяющая на основе преобразования родительской хромосомы (или ее части) создавать хромосому потомка[3].
Эволюционный поиск с точки зрения разбиения СБИС на части - это итерационное преобразование одного конечного нечеткого множества промежуточных решений в другое. Для работы итерационных ГА разбиения выбирают множество натуральных параметров модели коммутационной схемы и кодируют их в последовательность конечной длины в некотором алфавите. Они работают до тех пор, пока не будет выполнено заданное число генераций (итераций алгоритма), или на некоторой генерации будет получено решение определенного качества, или будет найден локальный оптимум. В отличие от других итерационных методов разбиения эти алгоритмы анализируют различные области пространства решений одновременно и поэтому они более приспособлены к нахождению новых областей с лучшими значениями ЦФ [3].
При реализации генетических операторов (ГО) одним из важнейших вопросов является определение места и количества точек разрыва хромосом (альтернативных решений) [1-3]. При этом большое количество точек разрыва может привести к полной потере лучших решений. Маленькое количество точек разрыва часто приводит к попаданию решения в локальный оптимум, далекий от глобального. Поэтому необходим поиск разумного компромисса в этом вопросе.
Предложим новые методы построения генетических операторов для решения задач задачи компоновки СБИС, используя теорию фигурных чисел, а также теорию строительных блоков.
Фигурные числа - общее название чисел, геометрическое представление которых связано с той или иной геометрической фигурой. Понятие восходит к пифагорейцам[4]. Различают следующие виды фигурных чисел:
Линейные числа - числа, не разлагающиеся на сомножители, то есть их ряд совпадает с рядом простых чисел, дополненным единицей: (1,2,3,5,7,11,13,17,19,23,...)
Плоские числа - числа, представимые в виде произведения двух сомножителей (4,6,8,9,10,12,14,15,...)
Телесные числа - числа, выражаемые произведением трёх сомножителей (8,12,18,20,24,27,28,...) и т. д.
Многоугольные числа. Если выложить из одинаковых кружков правильный многоугольник, то количество требуемых для этого кружков называется многоугольным числом.
Автором разработаны модифицированные генетические операторы на основе треугольных чисел. Треугольные числа относятся к многоугольным, т.е. треугольное число - это число кружков, которые могут быть расставлены в форме равностороннего треугольника [4], как показано на рис.1.
Рис. 1. Последовательность треугольных чисел.
Последовательность треугольных чисел задается следующей формулой:
Размещено на http://www.allbest.ru/
Фигурные числа, особенно треугольные, пользовались большой популярностью при изучении чисел в конце эпохи Возрождения, после того как греческая теория чисел проникла в Западную Европу. И сейчас их можно иногда встретить в статьях по теории чисел[4].
Рассмотрим построение модифицированных ГО на основе фигурных чисел. Длина последовательности фигурных чисел выбирается таким образом, что последнее фигурное число было меньше чем длина хромосомы . Если длина хромосомы равна 10, то последнее фигурное число для выполнения ГО равно 6. Число точек разрыва выбирается случайно на основе полученного множества фигурных чисел. Для примера, число точек разрыва может быть 1, 3, или 6. После определения точек разрыва хромосомы-потомки, получаются путем чередования строительных блоков родителей. В случае возникновения нелегальных решений(при появлении дублирующихся генов) применяется механизм коррекции ошибок на основе взаимного соответствия родительских генов. На основе правил замены генов, полученных после установления соответствия, выполняется замена повторяющихся генов на последних позициях.
Рассмотрим схему, показанную на рис.2. Гиперграф, моделирующий схему, представлен на рис.3.
Пусть для применения ГО выбраны хромосомы, показанные на рис.4(а). При ряд фигурных чисел для выполнения ГО имеет вид: 1, 3, 6. Случайным образом выбираем число точек разрыва на основе полученного ряда. Выберем три точки разрыва, как показано на рис.4(б). Хромосомы-потомки, полученные с помощью алгоритма модифицированного ОК, показаны на рис.4(в). генетический алгоритм селекция
Рис. 2. Условная схема.
Рис. 3. Гиперграф, моделирующий схему.
Вероятность выживания альтернативного решения с лучшим значением ЦФ после первого шага оператора вычисляется по формуле[5-6]:
, (1)
где L - длина хромосомы. Тогда, соответственно, вероятность устранения альтернативного решения с лучшим значением ЦФ вычисляется по формуле:
(2)
В рассматриваемом примере имеем:
, а .
Рис. 4. Выполнение ОК на основе фигурных чисел: а - хромосомы для применения ГО; б - точки кроссинговера в родительских хромосомах; в - формирование хромосом-потомков
Рассмотрим оператор мутации на основе фигурных чисел. Также как и для ОК, длина последовательности фигурных чисел определяется длиной хромосомы. Однако число точек мутации задается не самой последовательностью, а ее длиной. Например, если длина хромосомы равна 10, то длина ряда равна 3. Поэтому число точек мутации лежит в отрезке [1;3]. После определения точек мутации происходит перестановка генов.
Рассмотрим пример. Пусть имеется родительская хромосома длины 13, показанная на рис. 5(а). При ряд фигурных чисел для выполнения ГО имеет вид: 1, 3, 6, 10. Случайным образом выбираем число точек мутации из отрезка [1;4]. Выберем 4 точки мутации. Тогда ОМ будут подвержены гены в позициях 1, 3, 6, 10, согласно ряду фигурных чисел (рис.5(б)). Хромосома-потомок образуется путем перестановки генов между точек мутации, т.е. . Результат выполнения модифицированного оператора мутации показан на рис. 5(в).
Рис. 5. Выполнение ОМ на основе фигурных чисел: а - хромосома для применения модифицированного ОМ; б - точки мутации; в - результат применения ОМ на основе фигурных чисел
Вероятность выживания альтернативного решения с лучшим значением ЦФ после реализации оператора мутации на основе фигурных чисел определяется аналогично выражению 1. Отметим, что остальные модифицированные генетические операторы на основе рассмотренных методов строятся аналогично.
Применение модифицированных генетических позволяет сократить область поиска, что в сочетании с методами предупреждения попадания алгоритма в локальный оптимум образует компромисс между временем поиска решения и его качества. Кроме того, использование модифицированных ГО увеличивается вероятность "выживания" альтернативных решений с лучшим значением ЦФ и каждая новая генерация генетических алгоритмов приводит к сокращению интервала неопределенности, то есть области поиска.
Литература
1. Емельянов В.В., Курейчик В.В., Курейчик В.М. Теория и практика эволюционного моделирования. М.: Физматлит, 2003.
2. Гладков Л.А., Курейчик В.В., Курейчик В.М. Генетические алгоритмы. М: Физматлит, 2006.
3. Курейчик В.В. Эволюционные, синергетические и гомеостатические методы принятия решений. Монография. Таганрог: ТРТУ, 2001.
4. Оре О. Приглашение в теорию чисел. Изд-во: Едиториал УРСС, 2003.
5. Курейчик В.М. Генетические алгоритмы и их применение: Монография. Таганрог: ТРТУ, 2002.
6. Курейчик В.В., Сороколетов П.В. Эволюционные алгоритмы разбиения графов и гиперграфов. Известия ТРТУ. -№3, 2004. -С.23-32.
Размещено на Allbest.ru
Подобные документы
Операторы выбора родителей. Рекомбинация бинарных строк. Моделирование одно-, двух- и многоточечного, триадного кроссинговеров. Построение рулетки для отбора хромосом. Выбор партнера для скрещивания. Результаты применения генетических операторов.
курсовая работа [362,5 K], добавлен 27.03.2016Химический состав и уровни организации хроматина. Варианты гистонов и их действие на хроматин. Понятие и примеры кариотипов. Эволюция хромосом млекопитающих. Теломерные районы хромосом и схема работы теломеразы. Y-хромосома и карта Х-хромосомы человека.
контрольная работа [1,4 M], добавлен 14.02.2016Понятие и принцип работы генетического алгоритма. Вычисление функций приспособленности для особей популяции. Модель "эволюционного процесса". Основные операции генетических алгоритмов. Восстановление генов, выпавших из популяции в ходе операции выбора.
презентация [8,4 M], добавлен 25.06.2013Хромосомная теория наследственности. Генетический механизм определения пола. Поведение хромосом в митозе и мейозе. Классификация хромосом, составление идиограммы. Методы дифференциальной окраски хромосом. Структура хромосом и хромосомные мутации.
реферат [32,7 K], добавлен 23.07.2015Принципы решения генетических задач. Гомозиготные организмы как представители "чистых линий". Гетерозиготные организмы при полном доминировании. Моногибридное и дигибридное скрещивание. Определение генотипов организмов по генотипам родителей и потомков.
методичка [29,0 K], добавлен 06.05.2009Исследование условий племенного использования собак клуба, методов племенной работы с поголовьем, структуры популяции, представителей линий и семейств. Изучение биологических особенностей собак, генетических аномалий, применения инбридинга в селекции.
дипломная работа [9,9 M], добавлен 18.10.2011Хромосомы, их строение, видовая специфичность, кариотип. Роль хромосом в явлениях наследования. Формы хромосом на стадии метафазы. Мейоз как цитологическая основа образования и развития половых клеток. Сцепленное с полом наследование, транскрипция ДНК.
реферат [19,4 K], добавлен 19.03.2010Генетическое разнообразие форм растений и животных. Отбор и гибридизация как основные методы селекции растений. Пересадка генов и частей ДНК одного вида в клетки другого организма. Отбор генетически модифицированных организмов, их применение в медицине.
презентация [815,0 K], добавлен 30.01.2014Виды селекции и ее значение. Методы селекции микроорганизмов и животных. Биотехнология, генетическая и клеточная инженерия. Цели и задачи селекции как науки. Процесс одомашнивания новых видов растений и животных для удовлетворения потребностей человека.
курсовая работа [389,3 K], добавлен 10.09.2010Система зашифровки наследственной информации в молекулах нуклеиновых кислот в виде генетического кода. Сущность процессов деления клеток: митоза и мейоза, их фазы. Передача генетической информации. Строение хромосом ДНК, РНК. Хромосомные заболевания.
контрольная работа [28,4 K], добавлен 23.04.2013