Метод сборки контигов геномных последовательностей из парных чтений с ошибками вставки и удаления на основе совместного применения графов де Брёйна и графов перекрытий
Сборка генома как одна из задач современной биологии и медицины. Алгоритм, использующий небольшой объем оперативной памяти и позволяющий использовать чтения с ошибками вставки и удаления. Сборка контигов из квазиконтигов с использованием графа перекрытий.
| Рубрика | Программирование, компьютеры и кибернетика |
| Вид | статья |
| Язык | русский |
| Дата добавления | 15.01.2019 |
| Размер файла | 20,4 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Подобные документы
Этапы нахождения хроматического числа произвольного графа. Анализ примеров раскраски графа. Характеристика трудоемкости алгоритма раскраски вершин графа Мейниеля. Особенности графов, удовлетворяющих структуру графов Мейниеля, основные классы графов.
курсовая работа [1,1 M], добавлен 26.06.2012Применение теории графов и алгоритмов на графах среди дисциплин и методов дискретной математики. Граф как совокупность двух множеств. Основные способы численного представления графа. Элементы и изоморфизмы графов. Требования к представлению графов в ЭВМ.
курсовая работа [162,2 K], добавлен 04.02.2011Математические графы, области их применения. Способы раскраски вершин и ребер графов, задачи на их применение. Разработка алгоритма, работающего на основе операций с матрицей смежности. Описание логической структуры программы. Пример зарисовки графа.
курсовая работа [145,5 K], добавлен 27.01.2013Разработка класса "очередь с приоритетами" на языке С++ с использованием объектно-ориентированного проектирования. Построение алгоритмов обработки очереди, методов вставки, удаления, вывода на экран элементов. Анализ вариантов реализации очередей.
курсовая работа [398,6 K], добавлен 28.05.2016Области применения теории графов. Алгоритм решения задачи поиска инвариантного и полного графа. Реализация программы с графическим интерфейсом пользователя на основе алгоритма. Реализация редактора графа и вывод полученных результатов в понятной форме.
курсовая работа [493,3 K], добавлен 27.12.2008Основные понятия и определения теории графов: теоремы и способы задания графа, сильная связность графов. Построение блок-схем алгоритма, тестирование разработанного программного обеспечения, подбор тестовых данных, анализ и исправление ошибок программы.
курсовая работа [525,6 K], добавлен 14.07.2012В статье рассмотрен подход к созданию моделей композитного документооборота на основе аппарата теории графов. Описаны методы детерминирования множеств для разработанной модели, предложена алгебра документооборота с использованием графов.
статья [346,4 K], добавлен 19.04.2006Представление (построение, создание) списка данных в виде линейного однонаправленного списка. Формирование массива данных. Вывод данных на экран. Алгоритм удаления, перемещения данных. Сортировка методом вставки. Алгоритм загрузки данных из файла.
курсовая работа [2,1 M], добавлен 16.05.2015Граф - совокупность точек и линий, в которой каждая линия соединяет две точки. Представление графов в ЭВМ. Составление алгоритм Краскала с использованием графов с оперделением оптимального пути прокладки телефонного кабеля в каждый из 8 городов.
курсовая работа [241,5 K], добавлен 23.12.2009Представление задач в виде графов AND/OR, примеры. Задача с ханойской башней. Формулировка процесса игры в виде графа. Основные процедуры поиска по заданному критерию. Эвристические оценки и алгоритм поиска. Пример отношений с определением задачи.
лекция [154,6 K], добавлен 17.10.2013Хеширование как метод обеспечения быстрого доступа к большим объемам информации. Добавление в хеш-таблицу новой пары. Операции поиска, вставки и удаления по ключу. Практическое применение в теории баз данных, кодировании, банковском деле, криптографии.
презентация [212,2 K], добавлен 22.10.2013Подготовка к сборке компьютера. Установка процессора, оперативной памяти, материнской платы и винчестера. Подключение питания и периферийных устройств. Решение проблем при включении. Установка программного обеспечения, операционной системы, конфигурация.
курсовая работа [40,9 K], добавлен 26.04.2014Алгоритмы, использующие решение дополнительных подзадач. Основные определения теории графов. Поиск пути между парой вершин невзвешенного графа. Пути минимальной длины во взвешенном графе. Понятие кратчайшего пути для графов с помощью алгоритма Флойда.
реферат [39,6 K], добавлен 06.03.2010Описание действий во время сборки системного блока. Выполняемые работы, используемые инструменты. Установка в корпус материнской платы, процессора и кулера, модулей оперативной памяти, дисководов. Обжимка сетевого кабеля. Модернизация офисного компьютера.
отчет по практике [4,3 M], добавлен 30.04.2014Задача о кратчайшем пути как одна из важнейших классических задач теории графов. Общий обзор трех наиболее популярных алгоритмов для решения задачи о кратчайшем пути. Написание программы, которая реализует алгоритм Дейкстры и алгоритм Форда-Беллмана.
курсовая работа [2,1 M], добавлен 23.06.2014Общие данные об основных операторах языка SQL. Интерактивный режим работы. Использование языка SQL для выбора информации из таблиц, для вставки, редактирования и удаления данных в них. Связь между операциями реляционной алгебры и операторами языка SQL.
реферат [146,5 K], добавлен 06.02.2015Поиск источников ориентированного графа. Использование динамических структур при работе с графами. Способы представления графов, операции над ними, описание программной реализации. Процедуры и функции языка. Функции работы с динамической памятью, графами.
курсовая работа [58,6 K], добавлен 29.01.2009Теоретическое обоснование теории графов. Методы нахождения медиан графа. Задача оптимального размещения насосной станции для полива полей. Алгоритм Флойда, поиск суммарного расстояния до вершин. Функция нахождения индекса минимального значения в массиве.
курсовая работа [336,8 K], добавлен 28.05.2016История возникновения, основные понятия и теоремы теории графов. Способы предоставления графов в компьютере. Матрица смежности, инциденций, списки смежности и массив дуг. Программа определения кратчайшего пути в графах. Язык программирования Delphi.
курсовая работа [823,5 K], добавлен 24.11.2010Примеры построения тестов и технологии исследования алгоритмов на их основе. Построение тестов на основе метода покрытия решений и проведение исследования соответствующего исходного алгоритма и алгоритма с ошибками в операторах проверки условий.
контрольная работа [224,8 K], добавлен 24.05.2016
