Полиморфизм Y хромосомы у тюркоязычного населения Алтая, Саян, Тянь-Шаня и Памира в контексте взаимодействия генофондов Западной и Восточной Евразии
Характеристика генофондов изучаемых популяций на уровнях популяционной системы. Оценка соотношения межэтнической и внутри-этнической дифференциации генофондов по маркерам хромосомы. Анализ степени филогенетического родства тюркоязычных популяций.
Рубрика | Биология и естествознание |
Вид | автореферат |
Язык | русский |
Дата добавления | 02.08.2018 |
Размер файла | 4,7 M |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Наибольшее разнообразие обнаружено в сибирских кластерах «A». Среди N1b-A сегмента четко выделяются три киргизских кластера - в-1, в-2, в-3, южноалтайский кластер г и центральный кластер д, представленный в основном хакасскими популяциями (с невысокой специфичностью Sp=71%, т.к. сходные гаплотипы распространены среди большинства народов Южной Сибири и Средней Азии, табл. 4). Самым древним оказался южноалтайский кластер г, возраст который немногим моложе Волго-Уральского (8300±3300 лет).
Рис. 6. Филогенетическая сеть по 15 STR гаплотипам в пределах гаплогруппы N1b у народов Алтая, Центральной Азии и Волго-Уральского региона
Примечания: Цвет круга указывает на этническую принадлежность. Размер круга пропорционален количеству встреченных гаплотипов. Обозначения этнических групп приведены в легенде рисунка. Цифрами отмечены STR маркеры, в которых произошла мутация.
Самый молодой кластер - киргизский в-3 (1000±600 лет). Все три киргизских кластера отходят от центрального хакасского, что вновь указывает на южносибирское происхождение киргизов. Возможно, что часть популяции енисейских кыргызов, по одной из версий считающихся предками хакасов и современных киргизов (Степи Евразии в эпоху средневековья, 1981), избежавших насильственного переселения в Джунгарию, присоединились к Российской империи в составе хакасов (Потапов, 1969). Гаплотипы-основатели для выделенных кластеров приведены в табл. 5.
Таблица 4. Возраст кластеров STR-гаплотипов для гаплогрупп N1b, N1c1 и R1a1a
кластер |
состав кластера |
STRs |
специфичность кластера Sp |
генеалогическая скорость STR мутаций age-g |
эволюционная скорость STR мутаций age-e |
|
N1b-б1 |
Волго-Уральский |
15 |
90 |
4100±800 |
12400±2400 |
|
N1b-б2 |
Волго-Уральский |
15 |
91 |
1200±400 |
3600±1300 |
|
N1b-в-1 |
Киргизский |
15 |
83 |
2200±1200 |
6800±3500 |
|
N1b-в-2 |
Киргизский |
15 |
89 |
1900±1000 |
5900±3100 |
|
N1b-в-3 |
Киргизский |
15 |
86 |
300±200 |
1000±600 |
|
N1b-г |
Южно-Алтайский |
15 |
71 |
2700±1100 |
8300±3300 |
|
N1c1-б1 |
Волго-Уральский |
17 |
90 |
2100±900 |
6500±2800 |
|
N1c1-б2 |
Волго-Уральский |
17 |
93 |
400±200 |
1100±500 |
|
N1c1-б |
Волго-Уральский |
17 |
94 |
1900±600 |
5800±1700 |
|
N1c1-в |
Алтайский |
17 |
98 |
1100±400 |
3400±1200 |
|
R1a1a-б |
Киргизы+ю.алтайцы |
15 |
90 |
900±400 |
2600±1200 |
|
R1a1a-в |
Шорцы+с.алтайцы |
15 |
91 |
600±300 |
2000±900 |
|
R1a1a-г |
Шорцы+хакасы |
15 |
88 |
300±200 |
1100±700 |
|
R1a1a-д |
Северные алтайцы |
15 |
77 |
2100±900 |
6300±2900 |
|
R1a1a-е |
Южные алтайцы |
15 |
95 |
700±300 |
2200±800 |
|
R1a1a-ж1 |
Индийцы |
15 |
91 |
2900±1100 |
8800±3400 |
|
R1a1a-ж2 |
Индийцы |
15 |
91 |
4800±800 |
14700±2300 |
Примечания и обозначения: возраст в таблице указан от современности (BP - Before Present). STRs - количество STR маркеров, использованных для построения сети. Sp - специфичность кластера, т.е. процент образцов данного кластера, происходящих из популяций, указанных в названии кластера. age-g - возраст кластера в годах, рассчитанный на основе «генеалогической» скорости STR мутирования. age-e - возраст кластера в годах, рассчитанный на основе «эволюционной» скорости STR мутирования..
Гаплогруппа R1a1a. Анализ гаплотипов R1a1a позволяет выявить на региональном уровне ряд четких кластеров. Филогенетическая сеть (рис. 7) демонстрирует чрезвычайно высокое гаплотипическое разнообразие гаплогруппы R1a1a у индийцев и монголов: они не сгруппированы в отдельном кластере, а распределены по всей сети. Выделяются два «индийских» кластера (ж), со специфичностью 91%, причем возраст самого большого кластера ж-2 оценивается в 14700±2300 лет (табл. 4). Гаплотипы-основатели для выделенных кластеров гаплогруппы R1a1a по 15 STR маркерам приведены в табл. 5.
Представители народов Южной Сибири и Центральной Азии объединяются в пять кластеров (б, в, г, д, е). Из них три кластера смешанные: б (киргизы+южные алтайцы), в (шорцы+северные алтайцы), г (шорцы+хакасы). Северные и южные алтайцы образовали также два самостоятельных кластера - д и е соответственно. При этом в кластере «южные алтайцы» эффект основателя выражен особенно ярко. Максимальный возраст для сибирских кластеров обнаружен у северных алтайцев д (6300±2900 лет), а наиболее молодой кластер - г (1100±700 лет) образован гаплотипами шорцев и хакасов. Возраст остальных кластеров порядка 2000 лет. Таким образом, проведенный нами анализ подтверждает связь между народами Южной Сибири, Центральной Азии и Индии по гаплогруппе R1a1a, однако, связано ли появление гаплогруппы R1a1a на Алтае с первоначальным расселением по Евразии носителей этой гаплогруппы из Южной Азии или с более поздними западно-евразийскими миграциями остается не ясным. Однако можно уверенно утверждать, что территория Алтая была не центром происхождения этой гаплогруппы, а зоной вторичного заселения.
Таблица 5. STR гаплотипы-основатели (founder) для кластеров филогенетической сети
Гаплогруппа |
кластер |
DYS 19 |
DYS 389I |
DYS 389II |
DYS 390 |
DYS 391 |
DYS 392 |
DYS 393 |
DYS 437 |
DYS 438 |
DYS 439 |
DYS 448 |
DYS 456 |
DYS 458 |
DYS 635 |
GATA H4 |
|
N1b (P43) |
б-1 |
14 |
13 |
16 |
23 |
10 |
13 |
13 |
14 |
10 |
10 |
19 |
17 |
17 |
23 |
12 |
|
б-2 |
14 |
13 |
16 |
23 |
10 |
15 |
13 |
14 |
11 |
10 |
19 |
17 |
17 |
23 |
12 |
||
в -1 |
14 |
13 |
29 |
23 |
10 |
13 |
13 |
14 |
10 |
10 |
18 |
17 |
16 |
23 |
11 |
||
в-2 |
16 |
13 |
17 |
25 |
10 |
11 |
13 |
14 |
10 |
10 |
22 |
15 |
18 |
21 |
11 |
||
в-3 |
14 |
13 |
17 |
22 |
11 |
14 |
13 |
14 |
10 |
10 |
19 |
15 |
16 |
24 |
12 |
||
Г |
14 |
13 |
16 |
23 |
10 |
14 |
13 |
14 |
10 |
10 |
19 |
15 |
16 |
24 |
12 |
||
R1a1a (M198) |
Б |
16 |
14 |
18 |
25 |
11 |
11 |
13 |
14 |
11 |
10 |
21 |
16 |
15 |
23 |
12 |
|
В |
16 |
14 |
17 |
25 |
11 |
11 |
13 |
14 |
11 |
11 |
20 |
16 |
16 |
23 |
13 |
||
г |
16 |
13 |
16 |
24 |
11 |
11 |
13 |
14 |
11 |
10 |
20 |
16 |
15 |
23 |
13 |
||
д |
16 |
14 |
18 |
24 |
10 |
11 |
13 |
14 |
11 |
10 |
20 |
17 |
13 |
23 |
12 |
||
е |
16 |
14 |
17 |
26 |
11 |
11 |
13 |
14 |
11 |
11 |
19 |
15 |
15 |
23 |
11 |
||
ж-1 |
15 |
14 |
17 |
24 |
11 |
11 |
13 |
14 |
11 |
11 |
20 |
15 |
17 |
23 |
13 |
Примечание: в таблице приведены гаплотипы - основатели только для филогенетических сетей, представленных в тексте автореферата
Филогенетические сети для гаплогрупп C, C3(xC3c), D, N1b, N1c1, Q, R1a1a показывают две важные черты в изменчивости Y хромосомы на территории Алтая, Саян, Тянь-Шаня и Памира.
Во-первых, сходство кластеров может служить ещё одним аргументом в пользу гипотезы формирования изученных нами народов на общем палеоевропеоидном субстрате. Однако время дивергенции было достаточно велико для того, чтобы народы могли сформировать свои генетические особенности. Во-вторых, низкое гаплотипическое разнообразие у изученных тюркоязычных народов Южной Сибири и Центральной Азии может быть связано с «эффектом основателя». Наличие кластеров, характерных только для отдельных народов, свидетельствует о продолжительном периоде их самостоятельного развития.
Рис. 7. Филогенетическая сеть по 15 STR гаплотипам в пределах гаплогруппы R1a1a у народов Алтая, Центральной Азии и Индии.
Примечания: Цвет круга указывает на этническую принадлежность. Размер круга пропорционален количеству встреченных гаплотипов. Обозначения этнических групп приведены в легенде рисунка. Цифрами отмечены STR маркеры, в которых произошла мутация.
Выводы
1. По маркерам Y хромосомы в генофонде тюркоязычных популяций Алтая, Саян, Тянь-Шаня и Памира (общий объем выборки N=1101 человек) выявлены три главных направления потока генов: западно-евразийское (маркируемое гаплогруппой R1a1a), восточно-евразийское (гаплогруппы C, D, O) и северо-евразийское (N1b, N1c1 и Q). Миграции населения из Восточной Европы (гаплогруппы I и R1b1b2), Передней Азии (G и J) и Южной Азии (L) незначительны.
2. Основная тенденция в формировании генофондов изученных тюркоязычных популяций выражается в замещении западно-евразийского (палеоевропеоидного) компонента восточно-евразийским (монголоидным) компонентом. Монголоидное влияние более выражено в степных и пограничных со степью районах, чем в горах, которые сыграли роль «барьера», и в генофонде которых сохранился вклад протоуральских и палеоазиатских племен (гаплогруппы N1b, Q).
3. В генетическом пространстве изученные тюркоязычные популяции объединились в три кластера: Алтае-Саянский, степной и переходный между ними Памиро-Тяньшанский. По обеим системам маркеров Y хромосомы (SNP и STR) зафиксированы этногенетические связи киргизов с хакасами; шорцы наиболее близки к западно-евразийскому (европеоидному) кластеру; казахи целиком принадлежат восточно-евразийскому генофонду.
4. На различия между этно-территориальными объединениями Южной Сибири приходится только 6% межпопуляционной изменчивости, тогда как различия между малыми народностями в пределах этих объединений в три раза выше - 15% межпопуляционной изменчивости. Нарушение принципа эквидистантности свидетельствует о реальности малых этнических и родоплеменных групп и условности их традиционного объединения по географическому принципу.
5. Для наиболее частых гаплогрупп (N1b, N1c1, R1a1a, R1b1b1, Q, D) выявлены кластеры STR-гаплотипов, генетические датировки которых указывают на относительно молодой возраст генофондов народов Южной Сибири и Средней Азии (в среднем около 4000 лет). Наличие кластеров, специфичных для отдельных народов, свидетельствует о продолжительном периоде их самостоятельного развития, а низкое гаплотипическое разнообразие - о действии дрейфа генов (эффекта основателя).
Список опубликованных работ по теме диссертации
1. Балаганская О.А., Балановская Е.В., Лавряшина М.Б., Исакова Ж.Т., Сабитов Ж.М., Фролова С.А., Романов А.Г., Дибирова Х.Д., Кузнецова М.А., Захарова Т.А., Pitchappan R., Урасин В.М., Балаганский А.Г., Баранова Е.Г., Балановский О.П. Полиморфизм Y хромосомы у тюркоязычного населения Алтае-Саян, Тянь-Шаня и Памира в контексте взаимодействия генофондов западной и восточной Евразии // Медицинская генетика. 2011. Т. 10. № 3. С. 12-22.
2. Балаганская О.А., Балановский О.П., Лавряшина М.Б., Кузнецова М.А., Романов А.Г., Дибирова Х.Д., Фролова С.А., Захарова Т.А., Баранова Е.Е., Сабитов Ж., Нимадава П., Балановская Е.В. Генетическая структура по маркерам Y хромосомы народов Алтая (России, Казахстана, Монголии) / Вестник Московского университета. Серия XXIII. Антропология. 2011. № 2. С. 25-36.
3. Лавряшина М.Б., Ульянова М.В., Васинская (Балаганская) О.А., Фролова С.А., Дибирова Х.Д., Балановская Е.В. Генетический портрет десяти малых народов Южной Сибири. Сообщение I. Полиморфизм аутосомных ДНК-маркеров // Медицинская генетика. 2010. Т9. №3. С. 12-17.
4. Лавряшина М.Б., Ульянова М.В., Балаганская О.А., Балановская Е.В. Генетический портрет десяти малых народов Южной Сибири. Сообщение II. Гетерозиготность и подразделенность генофонда по данным об аутосомных ДНК маркерах // Медицинская генетика. 2010. Т9. №9(99). С. 16-23.
5. Васинская (Балаганская) О.А. Спектр гаплогрупп Y хромосомы у народов Алтае-Саянского нагорья и их соседей // Тезисы, посвященные юбилею МГНЦ РАМН. Медицинская генетика. 2009. Т.8. №12. С. 43.
6. Лавряшина М.Б., Васинская (Балаганская) О.А. Коренные народы Алтае-Саян: соотношения генофондов по данным об аутосомных ДНК маркерах // "Человек: его биологическая и социальная история". 2010. Т1. С. 218-224.
7. Васинская (Балаганская) О.А., Лавряшина М.Б., Исакова Ж., Сперанская А.С., Дружинина Е.Г., Балановская Е.В. Второй мировой максимум частоты СПИД протекторного маркера CCR5del32: генография Южной Сибири и Центральной Азии // V съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров. Москва 21-28 июня 2009. Ч.1. С. 397.
8. Васинская (Балаганская) О.А., Исакова Ж., Фролова С.А., Балановский О.П., Дибирова Х.Д., Дружинина Е.Г., Кошель С.М. Различия в генофонде киргизов Тянь-Шаня и Памира: данные по Y хромосоме // VIII Конгресс этнографов и антропологов России: тезисы докладов. Оренбург, 1 - 5 июля 2009 г. \ редкол. В.А. Тишков и др - Оренбург: издательский центр ОГАУ. 2009. С. 142-143.
9. Васинская (Балаганская) О.А., Лавряшина М.Б., Исакова Ж.Т., Тажигулова И.M., Дубербаев Д.М., Фролова С.А., Кузнецова М.А., Дибирова Х.Д., Захарова Т.А., Баранова Е.Г., Дамба Л.Д., Ульянова М.В., Балановский О.П., Балановская Е.В. Генетические связи генофондов Южной Сибири, Центральной Азии и Памира // Материалы VI Съезда Российского общества медицинских генетиков. Ростов-на-Дону, 14-18 мая 2010 г. Медицинская генетика. 2010. С. 34.
Размещено на Allbest.ru
Подобные документы
Исследование истории появления, происхождения, эволюции и особенностей строения Y-хромосом, половой хромосомы человека и других млекопитающих, которая имеется лишь у особей мужского пола. Анализ вероятности исчезновения Y-хромосомы вследствие мутации.
реферат [284,9 K], добавлен 15.09.2011Ферменты, их кодовый номер, буферные системы и количество локусов, использованные для анализа популяций лиственницы сибирской, лиственницы Сукачева и лиственницы даурской. Оценка степени генетической дифференциации. Генетический полиморфизм лиственниц.
курсовая работа [1,4 M], добавлен 18.02.2010Проведение гибридологического анализа на примере гороха. Период цветения и методика скрещивания. Методика проведения скрещивания у злаковых (пшеницы и ржи). Оценка плодовитости растений по пыльцевым зернам. Генетический полиморфизм популяций растений.
практическая работа [552,1 K], добавлен 05.12.2013Метод светорассеяния в изучении микробных популяций, использование установки для регистрации светорассеяния. Анализ зависимости светорассеяния популяций Staphilococcus aureus и Esherichia coli в питательном бульоне с добавками и физиологическом растворе.
лабораторная работа [38,5 K], добавлен 02.08.2013Наследственная информация, понятие хромосомы. Последствия изменения числа хромосом в кариотипе человека. Процедура определения кариотипа. Хромосомная теория наследственности, генетика пола. Явление наследования, сцепленного с полом. Хромосомные болезни.
контрольная работа [15,9 K], добавлен 24.12.2011Химический состав и уровни организации хроматина. Варианты гистонов и их действие на хроматин. Понятие и примеры кариотипов. Эволюция хромосом млекопитающих. Теломерные районы хромосом и схема работы теломеразы. Y-хромосома и карта Х-хромосомы человека.
контрольная работа [1,4 M], добавлен 14.02.2016Хромосомы, их строение, видовая специфичность, кариотип. Роль хромосом в явлениях наследования. Формы хромосом на стадии метафазы. Мейоз как цитологическая основа образования и развития половых клеток. Сцепленное с полом наследование, транскрипция ДНК.
реферат [19,4 K], добавлен 19.03.2010Причина генетически обусловленного мужского бесплодия. Гены RBMY и DAZ как "кандидатные" для субрегионов AZFb и AZFc. Детектирование делеций в трех субрегионах AZF-локуса. Частота микроделеций Y–хромосомы среди мужчин, результата генотипирования делеций.
статья [518,3 K], добавлен 31.07.2013Три категории популяций: географические, экологические и элементарные. Характеристика популяций: численность, плотность, распределение, возрастная структура. Основные демографические показатели: темп полового размножения, плодовитость, скорость отмирания.
презентация [339,6 K], добавлен 01.10.2015Различия в строении, размножении и поведении особей, обусловленные разными условиями среды обитания популяций. Численность особей в популяциях, ее изменение во времени. Возрастной состав популяции, возможность ее прогнозирования на ближайший ряд лет.
презентация [2,8 M], добавлен 26.02.2015