Фенотипові та генотипові властивості бактерій роду Pseudomonas − збудників бурої бактеріальної плямистості люпину

За результатами аналізу даних сиквенсу ДНК копій гену 16S рРНК 8 досліджених штамів виключно штам 8531 має 100% гомологію нуклеотидної послідовності гену 16S рРНК з задепонованою у GenBank нуклеотидною послідовністю цього гену P. savastanoi pv. glycinea (табл.6).

Таблиця 6 Ідентичність нуклеотидних послідовностей гену 16S рРНК штамів "P. lupinі" з нуклеотидними послідовностями гену 16S рРНК бактерій, які зберігаються у нуклеотидній базі GenBank

Решта досліджених штамів, незважаючи на варіабельність ГЦ складу геномної ДНК, високо споріднені з нуклеотидними послідовностями, що кодують ген 16S pPHK (98-99% гомології), задепонованими у GenBank, деяких патоварів, які за сучасними даними входять як до виду P. syringae, так і до P. sаvastanoi(табл.6).

Серед точкових змін, виявлених в результаті вирівнювання нуклеотидних послідовностей, зустрічаються такі, що притаманні цілій групі різних видів, та такі, що властиві лише окремим штамам. Серед усіх досліджених штамів "P. lupinі" найбільша варіабельність нуклеотидної послідовності гену 16S pPHK спостерігається у штаму 8533. Жодної точкової зміни нуклеотидних послідовностей гену 16S pPHK не виявлено як у штаму 8531, так і у задепонованої у GenBank нуклеотидної послідовності цього гену P. savastanoi pv. glycinea.

Всі 7 штамів "P. lupinі", а також типовий штам P. syringae рv. syringae В 1027, утворили окрему групу значно споріднену з групою P. syringae рv. syringae, P. savastanoi рv. phaseolicola та P. savastanoi рv. Glycinea. Серед 7 штамів "P. lupinі" найбільш генетично уособленим є штам 8531

Отже, більшість досліджених штамів за генотиповими і фенотиповими ознаками належать до виду P. syringae. І лише штам 8531 на основі антигенної спорідненості та генотипової подібності віднесено до Pseudomonas sаvastanoi pv. glycinea. Тобто, збудник "P. lupinі" не є окремим видом, а бура бактеріальна плямистість люпину викликається фітопатогенними бактеріями, які належать до двох видів Pseudomonas syringae і Pseudomonas sаvastanoi.

Висновки

1. Встановлено, що збудник бурої бактеріальної плямистості люпину "P. lupini" Beltjukova, Koroljova не є самостійним видом. За фенотиповими та генотиповими ознаками більшість штамів "P. lupini" віднесено до виду P. syringae.

2. За патогенними, морфологічними, культуральними, фізіологічними та біохімічними властивостями збудник бурої бактеріальної плямистості люпину є подібним до типового штаму P. syringae рv. syringae В 1027.

3. Популяція збудника бурої бактеріальної плямистості у природі є серологічно гетерогенною: 88% досліджених штамів віднесено до ІІІ і лише 12% - до І серогрупи.

4. Вперше показано подібність жирнокислотних профілів клітинних ліпідів штамів "P. lupini" та типового штаму P. syringae рv. syringae В 1027.

5. Вперше визначено гетерогенність вмісту ГЦ пар у геномній ДНК збудника бурої бактеріальної плямистості люпину. За цією ознакою більшість штамів подібні до виду P. syringae і тільки штам 8531 ? до виду P. sаvastanoi.

6. Вперше визначено нуклеотидні послідовності гену 16S рРНК 7 штамів

"P. lupinі". Встановлено, що 6 штамів за цією ознакою на 98-99% споріднені з видом P. syringae, а штам 8531 має 100% гомологію з P. sаvastanoi pv. glycinea.

7. Рівень стійкості сорту люпину до збудника бурої бактеріальної плямистості залежить від вмісту у ньому алкалоїдів, а саме: безалкалоїдні ? чутливі, мало та високоалкалоїдні ? відносно резистентні.

8. Показано здатність збудників бурої бактеріальної плямистості люпину уражати широке коло бобових культур, що необхідно враховувати при створенні коректної сівозміни.

Перелік наукових праць, опублікованих за темою дисертації

1. Гвоздяк Р.І., Данкевич Л.А., Воцелко С.К., Голубец О.В. Жирнокислотний склад клітинних ліпідів колекційних та свіжовиділених штамів "Pseudomonas lupinі" // Микробиол. журн. ? 2005. - Т.67., № 5. ? С.28?36. (Здобувачем самостійно підібрано оптимальний для фітопатогенних псевдомонад метод екстракції жирних кислот та вивчено жирнокислотний склад клітинних ліпідів 23 штамів "P. lupinі")

2. Данкевич Л.А., Гвоздяк Р.І. Антигенний склад штамів "Pseudomonas lupinі", виділених у 1963 та 2002 роках. // Микробиол. журн. - 2005. - Т.67., № 6. - С.24-32. (Здобувачем самостійно досліджено антигенні властивості 18 штамів "P. lupinі" та проведено їх серогрупування)

3. Данкевич Л.А., Гвоздяк Р.І. Генотипові властивості збудника бурої бактеріальної плямистості люпину // Біополімери і клітина. - 2006. - Т.22., № 2. - С.121-126. (Здобувачем самостійно визначено вміст ГЦ складу геномної ДНК та проаналізована нуклеотидна послідовність гену 16S рРНК 7 штамів "P. lupinі" та типового штаму P. syringae pv. syringae В 1027)

4. Данкевич Л.А. Спеціалізація "Pseudomonas lupini" на люпині, горосі, квасолі та сої // Науковий вісник Чернівецького університету: Збірник наук. праць. - 2004. - Вип. 194. - С. 47 - 52.

5. Данкевич Л.А., Гвоздяк Р.І. Патогенні та біохімічні властивості збудника бурої бактеріальної плямистості люпину "Pseudomonas lupinі" // Агроекологічний журнал. - 2005. - №1 -C.63-68.(Здобувачем самостійно досліджені патогенні, морфологічні, культуральні, фізіологічні та біохімічні властивості 23 штамів "P. lupinі")

6. Данкевич Л.А., Мороз C.М., Кищенко В.А., Голубец О.В. Жирнокислотний склад клітинних ліпідів "Pseudomonas lupinі" // Вісник Одеського Національного Університету. Серія: Біологія. -2005. Т.10- Вип. 3. - С. 147 - 180. (Здобувачем самостійно вивчено жирнокислотний склад клітинних ліпідів колекційних штамів "P. lupinі")

7. Данкевич Л.А. Патогенные и биохимические свойства "Pseudomonas lupini "// 8-я Пущинская школа-конф. молодых ученых "Биология ? наука XXI века": Сборник тезисов (17 - 21 мая, 2004 г.). - Пущино: Пущинский научный центр РАН, Ин-т физико-химических и биологических проблем почвовединия РАН, 2004. - С.147.

8. Данкевич Л.А., Яковлева Л.М. Антигенная гетерогенность "Pseudomonas lupinі" // Современное состояние и перспективы развития микробиологии и биотехнологии: Материалы Международной конференции (26-28 мая 2004 г.). ? Минск: Национальная академия наук Беларуси, Ин-т микробиологии, 2004. - С.16 - 17.

9. Данкевич Л.А., Мороз С.М. Жирнокислотний склад клітинних ліпідів "Pseudomonas lupinі" // X з'їзд Товариства мікробіологів України: Тези доповідей (15-17 вересня). ? Одеса, 2004. - С.43.

10. Данкевич Л.А. Хактеристика клеточных липидов "Pseudomonas lupini" по жирнокислотному составу // 9-ая Пущинская школа-конференция молодых ученых "Биология ? наука XXI века": Сборник тезисов (18 - 22 апреля, 2005 г.). - Пущино: Пущинский научный центр РАН, Ин-т физико-химических и биологических проблем почвовединия РАН, 2005. - С.189.

11. Данкевич Л.А. Залежність жирнокислотного складу загальних клітинних ліпідів Pseudomonas syringae від методу їх виділення // Молодь і поступ у біології: Матеріали Першої Міжнародної конференції студентів і аспірантів (11 - 14 квітня 2005 р.). - Львів: Львівський нац. ун-т ім. Івана Франка, 2005. -С.163.

12. Данкевич Л.А., Гвоздяк Р.І. Генотипові властивості збудника бурої бактеріальної плямистості люпину ? "Pseudomonas lupini" // 4?та Міжнародна конференція "Фітопатогенні бактерії. Фітонцидологія. Алелопатія.": Тези доповідей (4?5 жовтня 2005 р.).- Київ, Ін-т мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного НАНУ, 2005. - С.50

Размещено на Allbest.ru